肾积水伴输尿管结石可以通过一般治疗、药物治疗、手术治疗来改善病情。
1、一般治疗：当出现肾积水合并输尿管结石时，患者可能会出现恶心呕吐、腰腹部疼痛、排尿困难、血尿等不适，在治疗的过程中要注意多喝水，适当的运动，一般有利于缓解梗阻的情况。
2、药物治疗：建议遵医嘱进行药物治疗，如使用枸橼酸氢钾钠颗粒、碳酸氢钠片等药物，可以碱化尿液，促进结石排出。如果出现了肾绞痛，一般要遵医嘱应用双氯芬酸钠缓释胶囊等非甾体类镇痛抗炎药物。
3、手术治疗：在保守治疗无效的情况下，可积极就医，采用体外冲击波碎石、经皮肾镜碎石术、输尿管镜碎石等方法进行治疗。
输尿管结石伴肾积水时，超过一公分以上的结石大部分需手术取石，小于一公分的结石可在医生指导下通过饮水和跳绳等保守方式来排石，另外，日常生活中应预防高尿酸血症，避免高嘌呤饮食。
输尿管结石伴有肾积水，提示已出现梗阻性肾病，建议积极排石治疗，尽早解除梗阻。根据结石的大小，可以采取内科治疗和外科治疗。如果结石直径小于0.6cm，一般通过应用解痉的药物，比如654-2，钙离子拮抗剂，多饮水，多运动可以排除体外。如果结石超过0.8cm，就要采取外科治疗，比如体外震波碎石，或者是输尿管镜，或者是开放手术治疗。
尿管结石伴有肾积水，提示已出现梗阻性肾病，建议积极排石治疗，尽早解除梗阻。根据结石的大小，可以采取内科治疗和外科治疗。如果结石直径小于0.6cm，一般通过应用解痉的药物，比如654-2，钙离子拮抗剂，多饮水，多运动可以排除体外。如果结石超过0.8cm，就要采取外科治疗，比如体外震波碎石，或者是输尿管镜，或者是开放手术治疗。
如果结石大于0.5厘米小于1.2厘米，结石嵌顿的时间不长，肾积水不严重，可以考虑体外震波碎石。如果结石在输尿管下段，怀疑有肉芽组织包裹，建议行输尿管镜钬激光碎石。如果结石在输尿管上段，可以考虑输尿管软镜或者经皮肾镜手术。
可以进行体外冲击波碎石，碎石后结石排出输尿管梗阻恢复通畅，则肾积水即可消失。如果结石巨大，并且是多发结石，呈石街样改变，可以行腹腔镜输尿管切开取石或手术开放切开取石。