胆囊结石且胆囊萎缩应该手术治疗，因为胆囊结石的癌变率大概10%，当胆囊出现萎缩的时候，说明胆囊的功能就不健全了。这时候胆囊既然没有功能，里面又有大量的结石，这样引起癌变几率比较大。
胆囊结石做胆囊切除手术是有一些指征的，当没有症状而且结石较小的时候可以完全不手术，临床随访观察就行了，比如每年一次进行健康体检。当结石＞3㎝的时候，由于结石对胆囊壁的持续刺激会导致胆囊癌的发病率大大的增加，因此不管有没有症状，对于胆囊巨大结石行胆囊切除手术。
采取非手术措施控制急性炎症期。症状缓解后，可选择手术。内窥镜手术创伤小，疼痛小，适用于下胆总管结石数量少，直径小。如果持续半小时，腹部用胀痛感，可以考虑为胆囊结石引起的，可以进行彩超检查，有疼痛感，可以口服利胆消炎的药物调理的，也可以采取中药调理。在治疗期间，不可以吃刺激性、油腻的食物的慑入。
胆囊结石可能是以下原因引起的。
胆囊结石是由多种原因造成的，不管是什么原因造成的，都会导致胆汁的酸性、胆固醇的代谢紊乱，从而导致胆汁在胆囊内沉积，从而导致胆囊内的结石。肥胖、长期暴饮暴食、高脂肪、高蛋白饮食、高脂血症、糖尿病、胃肠道手术、肝硬化等都属于高风险的危险因子。另外，一些年轻人因为不喜欢吃早饭，导致胆囊中的胆汁滞留太久，导致了胆囊结石的发生。
产妇胆囊结石通常可以使用药物来治疗，在产后行手术。
如果怀孕时有胆囊结石，通常不能做胆囊切除手术，因为胆囊切除术是要做全身麻醉的手术，这样会对怀孕产生一定的影响。建议在产妇在生产后再进行外科手术。如果怀孕期间因胆囊结石而出现胆囊炎，可应用抗生素或利胆的药物来控制感染，如感染持续时间过长，且已临近产期，则应在取出胎儿后进行胆囊切除，以控制病情发展。
