冲洗用药分两种，有冲一次的双氧水，然后用止痛药止痛。也有冲两次的，生理盐水和双氧水交替冲，然后用止痛药止痛。早期可以用局部理疗促进炎症吸收，如果脓肿形成可以切开引流，配合全身治疗，可以根据病情选用抗菌药物，或者是内服清热解毒的中草药进行治疗。
智齿冠周炎是必须拔智齿的。智齿冠周炎要等炎症控制之后尽早的拔牙，以防冠周炎再次复发。控制炎症，当炎症转入慢性期之后，如果是不能萌出的阻生牙，就需要尽早的拔除，以防止智齿冠周炎再次发生。
每日可用适量的过氧化氢溶液及生理盐水或其他灭菌溶液冲洗盲袋，然后点入部分碘甘油。另给复方硼砂液或呋喃西林液等含漱，一日多次。如脓腔形成，可切开引流。勤刷牙，勤漱口，保持口腔清洁，防止炎症发生。
急性智齿冠周炎想快速消肿，可以及时去口腔颌面部做冠周局部冲洗上药治疗，如果脓肿已经形成，有脓肿切开引流术，口服消炎药或输液抗感染治疗等炎症消退后拍牙片考虑是需要拔除智齿。
智齿冠周炎脓时，患者对镜自检可发现患处黏膜红肿，触摸有疼痛，挤压还可在里边挤出黄色的脓液，这时发生脓肿如延误就医，或是全身抵抗力较差的时候，会导致炎症扩散，从而引起颌间间隙感染，导致面部肿胀等情况。
