复发几率不大。巧克力囊肿术后人的对侧卵巢或同侧卵巢可能有新的病灶，医生又要开始重新用药，甚至有可能要面临再次手术。如果这种病人做过2-3次的手术以后，卵巢体积就会缩小，也就预示着卵巢功能会下降，将来有可能面临早绝经，或者卵巢的抗缪勒氏管激素会下降，卵巢的储备功能下降。
防止甲状舌管囊肿术后复发在手术中需要进行切开引流。
如果出现感染，应在2-3个月后进行瘘管切除，或进行甲状舌管囊肿切除。想要彻底的根治，首先要做好脓肿的切开引流，然后进行外科手术，去除甲状舌管囊肿需要将舌骨的中段和后面的肌肉和舌骨的盲孔全部切除，这样就不会再出现复发的情况了。并且患者在术后还需要做好护理工作，避免出现感染。
一般情况下，怀孕初期有卵巢囊肿可能是激素水平变化造成的，具体内容如下：
在怀孕后，女性体内激素水平变化，女性的卵巢会产生一种叫做“黄体”的物质，黄体会分泌一些激素来保证女性的正常孕期，这种情况下，黄体也会逐渐增大，可能会出现卵巢囊肿，这其实是黄体体积变大导致的卵巢的黄体囊肿。一般怀孕2个多月后，黄体就会慢慢的出现胎盘，这时候的卵巢囊肿就会慢慢的消失，因此，女性无需过度紧张，定期进行产检，明确自身情况即可。
腱鞘囊肿术后3个星期之内不能做任何激烈的运动，特别是关节部位的剧烈、频繁的活动会引起肌腱鞘囊肿的反复发作，由于术后的局部组织尚未完全复原，过度的活动会造成大量的粘液流，从而使术中软肋部位出现囊肿。一些病人在手术中可能会出现粘连等症状，主要是因为长期的受限运动，所以要进行功能锻炼和康复治疗。经过积极的处理，可以得到显著的减轻或者回到正常人的状态。
因为卵巢囊肿种类很多，有上皮性肿瘤，复发率较低一些，如果是子宫内膜异位囊肿，就是俗称巧克力囊肿，复发率是很高的，所以做巧克力囊肿术后必须进行药物治疗。药物治疗期限三个月到半年，这个期限，咱们大大降低它的复发率。卵巢囊肿一旦复发，首先要观察生长的速度，如果生长的速度仍然很快，二次进行手术，如果生长速度很慢，就可以进行药物治疗。药物治疗可以用一些中药、蒙药治疗，都是用舒筋活血的药物。
