一般情况下，小孩做脑CT和核磁共振有一定伤害，但是伤害较小。
小孩做脑CT，通常有一定的辐射损小孩的全身影响是比较小的，因为一次脑CT受到的辐射量通常是有限的，只要不是多次进行，一般不会造成较大的伤害。而核磁共振对于孩子的伤害则相对更小，因为核磁共振的成像一般和射线没有较为明显的关系，因次，也不会对小孩造成较为明显的辐射性损伤。
CT比核磁共振准确，不是核磁共振就比CT好，需要结合具体的疾病以及检查的部位。如果是发病的急性期，怀疑颅脑出血、蛛网膜下腔出血，CT是首选的检查。头部的核磁共振在检查脑梗死上，较头颅CT而言更加精确。
ct对人体的辐射，自然是最大的。ct是利用X光X线进行CT检查，然后通过电脑进行综合比较，得到的结果。一般的ct检查，相当于几次或几十次的x光照射，因此，如无特别需要，不宜频繁的ct。而核磁共振仪则是将人体内的电磁波信号收集起来，然后用影像来显示。目前还没有相关的医学记录来证明电磁对人体的伤害。
脑CT和磁共振的区别通常是比较大的。
脑CT和脑核磁是两种截然不同的检查方式，他们的关注点也不一样，虽然可以看到相似的地方，但却有着很大的差别。脑部CT是出血性疾病的首选，而脑部核磁共振则是缺血性疾病的首选。此外，磁共振检查所需要的检查时间会比头颅CT要长很多，一般脑CT检查只需要数10秒或者1分钟就能完成，而磁共振检查通常需要十几分钟，甚至更长时间。
做完核磁共振，如果不着急怀孕，可以等三个月。核磁共振对人体的辐射也是相当大的，女性在备孕期间，是不能够做核磁共振检查的，因为做完检查之后，体内会残留放射线，对怀孕也是有不利影响的，容易造成畸胎。
核磁共振。这两种检查的基本原则是不同的。电脑控制下的x光扫描人体的身体层。增强扫描是一种造影剂的注射，主要检查肝内血管和占位性病变。核磁共振是一种通过收集磁共振现象产生的信号来重建图像的成像技术。肝脏检查和腹部平增强扫描可以，磁共振成像对判断肝脏肿瘤也很有帮助。
