先天性的双眼球萎缩通常是先天性发育不良引起的，是先天性的疾病，后天没有效办法可以治疗，可表现为畸形小眼眶，结膜囊狭窄，眼球萎缩不再生长，并导致同侧眼眶颜面部发育障碍。带孩子去医院定期复查，能维持现有的视力和外形，避免越来越严重。
要增加维生素b、c的摄入，维生素c缺乏，易使脑细胞的结构松弛或紧张。b族维生素能帮助蛋白质代谢，促进脑细胞兴奋、抑制机构更好的发挥作用。要补充合钙质的食物，要供给丰富的蛋白质。
通常来说，先天性黄疸是通过药物治疗的。
体内胆固醇水平明显偏高会导致新生儿出现黄疸，新生儿出现黄疸一般使用益生菌、茵栀黄口服液等药物进行治疗。益生菌可以有效调节儿童的肠道菌群，茵栀黄口服液可以有效的减少胆红素的肝肠循环。药物治疗可以很好地降低新生儿的先天性黄疸水平。如果先天性黄疸使用药物治疗无效，可能还要考虑手术治疗。
先天性心脏病患者，在咨询专业的医生后，可以考虑选择药物治疗。
药物疗法的目的是为了提高心脏的机能，因为随着年纪的增加，病情的恶化，心脏的机能会下降，这时候可以选择一些有强心性的药物，比如地高辛，或者是服用一些提高心脏机能的药，比如呋塞米利尿；一些病人出现了加速的心脏跳动，这时可以使用一些降低心率的药，比如倍他；另外一些病人由于其心脏的构造异常，更容易出现血栓，需要服用一些抗凝的药物，比如阿司匹林、华法林等。
先天发育不良导致的白内障也是可以治疗的。要尽快带孩子去正规医院的眼科进行检查，如果白内障非常严重，手术摘除白内障，把孩子在三周岁左右可以置换人工晶体。同时，根据情况做弱视训练。但如果孩子目前年龄偏大，超过12周岁，那治疗效果就不是太好。
一般情况下，对心脏血液动力学影响比较小的先天性心脏病可以不做手术治疗，具体内容如下：
先天性心脏病是先天发育异常所引起的心脏病，会对患者的心脏功能、血液循环等产生一定的影响。如果患者所患有的先天性心脏病没有对心脏血液动力学产生比较大的影响，如房间隔卵圆孔未闭，或患者并未出现左右心房血液的分流、反常栓塞等情况，通常可以不采取手术而进行治疗，但仍然需要定期进行检查，以明确心脏状况，以免耽误病情。
