支原体衣原体检查就是到医院做化验就可以了。支原体、衣原体通过血液以及分泌物的方法都可以检查。如果确诊有支原体，衣原体感染，要注意积极使用药物治疗。并且注意定期复查，暂时注意避免性生活的，饮食要注意清淡，多注意喝水。
进行肛门检查，首先应当选择合适的体位，可选择膝胸位、截石位、弯腰俯卧位，有时也可以采取左侧卧位，选择合适的体位，对检查疾病有很大的帮助。首先应当进行肛门视诊，观察肛门的位置是否有异位变形等。然后观察肛门周围的皮肤及颜色，是否存在着红斑、糜烂、渗出，是否有肿物。
男性检查支原体是取分泌物来做检查。支原体感染主要是通过不洁性生活来进行传播，支原体感染的常见临床症状是尿道会出现粘液或者是脓样的分泌物，还会出现尿痛，尿道刺痒，肉眼血尿等临床症状，如果尿道口出现分泌物，可以直接去做分泌物培养检查。
确诊是否患有非淋球菌性的尿道炎，属于一种尿道感染，也属于一种性传播疾病。常常见于不洁的性接触史，而致使自己或者伴侣发生感染。感染后患者可出现尿道内瘙痒、尿频、尿急、排尿灼热等症状，并且尿道分泌物增多，可见白色或者淡黄色的稀薄样的分泌物。
检查支原体衣原体就是查有没有这两类病原体的感染，因为支原体衣原体感染是属于性传播疾病。而且在女性怀孕以后，可能会引起出现自然流产，甚至是胎儿畸形的风险。所以可以作为常规的孕前检查。在检查出现支原体衣原体阳性的情况下，都需要做药敏实验来选用具体的药物治疗，治疗时需要夫妻同治，以免导致出现再次交叉感染。
检查主要可以通过抽血查抗体或者定量，也可以取局部分泌物检查。这两种病原体感染引起的临床症状相似。呼吸道感染主要以顽固性干咳为主，泌尿生殖系统感染主要症状有尿频、尿急、分泌物增多或者有异味。