对于肾盂囊肿，包括肝肾囊肿，如没有症状或长的速度很慢，一般不要治疗。对于生长很快的囊肿或有压迫临组织的囊肿还是主张手术治疗。药物对囊肿的吸收基本无效。半年到一年复查一次B超，如有不适及时复查。吃药可能效果不好，还增加心理负担和经济负担。
问题不大的，也就是说可以不用做手术处理，那么如果是周边的一些组织都会受到影响，那么就不能够停止任职，可以采取更有效的方式进行切除，可能效果相对来说会更好一点，但是也需要看身体情况。
目前手术治疗首选腹腔镜下肾盂旁囊肿去顶减压手术。因为囊肿和肾盂的关系密切，手术有一定的难度，术后出现漏尿的几率也比一般肾囊肿的手术要高一些。术后要密切观察引流量，如果出现漏尿，引流管要长期置放，以致形成瘘道后再拔除。
囊肿的话是属于一种良性疾病的，没有什么不适的话可以观察。如果囊肿不是特别大并且是单个囊肿的话就注意定期复查，可以半年查一下超声看看。如果大小没有变化的话没什么事的也不用治疗。
肝脏的囊肿绝大多数都是先天性的，是肝内胆管胚胎发育障碍所致的，也有一小部分是后天性的，是因为肝脏的退行性改变所致，一般女性患者多于男性。肝脏的小囊肿是影像学检查中非常常见的一种良性占位，肝囊肿在肝内生长非常缓慢，小的肝囊肿对肝脏的内部组织结构受压或者外部的形态改变都没有任何影响。一般患者没有什么症状，在体检时偶然发现。
卵巢囊肿在3.25厘米以下，或有太多的思想负担，3.5，厘米以上，可以考虑手术治疗，因为小的卵巢囊肿可以自行吸收，自然消失，实在不放心，可以去检测一下肿瘤标记物检查。对于育龄期妇女，发现一个卵巢囊肿后，要视囊肿的性质决定下一步的处理。
