当血液中甲状腺激素的水平下降就可以诊断是甲状腺功能减退。进一步检查，包括甲状腺功能，甲状腺自身抗体，甲状腺同位素扫描，心电图，心脏彩超等，确诊是甲减，可以用甲状腺激素替代治疗，同时查找病因，进行去除病因治疗。
甲状腺功能对于新生儿大脑发育及体格都很重要，尤其是脑发育，因此新生儿甲状腺功能减低症需早期发现早期治疗以最大限度地减少后遗症。
新生儿甲减可分为暂时性甲减及永久性甲减，暂时性甲减主要因母亲的影响、新生儿疾病及早产儿中枢发育延迟所致，经过数月的治疗新生儿本身甲状腺功能将逐步恢复并可逐步停药，多数甲减属于暂时性甲减，永久性甲减以甲状腺缺如、移位及酶缺陷为主，需终身用药，且永久性甲减发生率较低，因此若确诊甲减需寻找病因。
一般情况下，新生儿甲减能治愈吗需根据实际情况来判断，具体内容如下：
新生儿甲减并不能完全治愈，但是可以通过服用甲状腺激素来促进孩子的生长，不会对孩子的智商造成任何的伤害。甲状腺激素是一种非常重要的荷尔蒙，如果因为甲状腺功能低下，导致体内的甲状腺激素分泌不足，会影响到孩子的智商，从而导致痴小症。定期给药可以代替甲状腺的分泌，从而提高机体的吸收能力，从而促进机体的生长和智能的发展，能有效缓解甲减引起的不适症状。
新生儿甲减的确诊只需要通过身体血液的检查就可以诊断，在甲状腺功能检测当中，甲减的患儿会出现T3，T4水平明显下降的现象，特别是对于一些有甲状腺疾病的家族史。在新生儿出生以后，应该尽量的提早的通过检查足跟血来进行甲状腺疾病的筛查。
甲减是由于甲状腺激素产生或分泌减少，或由于甲状腺激素受体缺欠，而不能发挥甲状腺激素的生理作用。表现有三个主要特点：智力迟钝、生长发育迟缓及基础代谢率低下。实验室检查血清T4降低，T3轻者正常，重度甲减时减低。如果TSH、T4都低，是继发于下丘脑、垂体的甲减。典型甲减表现就可确诊，早诊断早治疗。不典型甲减可结合化验、X线检查以确诊。
