注射乙肝疫苗后，人体免疫系统会对疫苗中的蛋白质抗原产生反应，一般在注射疫苗后大约一个月左右就会产生抗体，刚开始抗体水平很低，到了第二针，抗体水平就会迅速上升，很快就能抵抗乙肝病毒感染。接种乙肝疫苗后，从理论分析半个月后会逐渐产生抗体。不过早期抗体的浓度比较低，接种三针结束后，90%以上的患者都会出现保护性抗体。
乙肝疫苗有一定的时效性，一般在3~5年。接种乙肝疫苗后人体乙肝表面抗体（抗—HBs）转阳率在95％以上，抗体滴度越高，免疫力越强，持续时间也越长。但也有少数人在接种乙肝疫苗后，一直产生不了抗体。因此全程接种乙肝疫苗1个月后，应该抽血化验抗体是否产生。
接种乙肝疫苗是为了预防感染乙型肝炎病毒，目前接种乙肝疫苗方案就是第一次打了第一针，之后一个月的时候打第二针，第六个月的时候打第三针，前面两针主要是产生抗体，第三针主要是加强抗体的，在打完第三针之后过两个月也就是第八个月的时候可以做乙肝两对半检查化验看有没有抗体。
通常情况下，小孩乙肝疫苗的每针接种时间是不同的。
乙肝疫苗一般是需要注射三针，注射完第一针，一个月以后注射一针，六个月以后再注射一针。但是在成长过程中需要复查乙肝五项，如果有乙型肝炎表面抗体，证明接种成功，小孩一般就不会得乙肝。但是没有乙型肝炎表面抗体，表示疫苗接种失败，此时小孩需要再次接种乙肝疫苗。家长注意保护接种部位的清洁和干燥。
乙肝疫苗在注射第一针后，30%的人产生表面抗体，第二针后50到70%的人产生表面抗体，第三针90%的人产生表面抗体。在全程注射完乙肝疫苗一个月后，应再次检测乙肝表面抗体产生抗体。
