由于烂牙根内长期有感染或病原刺激物存在，根尖周围组织会呈现慢性炎症反应。根尖逐渐形成肉芽组织，根部的牙槽骨遭到破坏。由于根尖的肉芽组织内含有发育期留下的剩余上皮，当上皮团块中心缺氧时，上皮会发生坏死液化，进而形成囊腔，最终形成囊肿。所以当烂牙根不起作用的时候，要及时拔除，以免形成囊肿。在身体免疫力低下时烂牙根尖的致病细菌数量和毒力会增大,导致疼痛加剧,感染扩散到面部软组织间隙内,使面部肿胀、疼痛,还会引起菌血症。建议尽早去正规医院拔除，拔牙后勿用舌头舔触创口，更不宜反复吸吮，以防止出血，另外可以用生理盐水漱口，注意口腔卫生。
烂牙根不拔会形成根尖炎，时间久了就会引起牙龈脓包或者间隙感染，严重的会引起败血症，危及生命，烂牙根长期不拔始终是一种病灶存在体内，也可引起机体的其他全身疾病。
拔烂牙根，首先要确定牙根是不是有炎症。正常下，拔牙不会痛，因为会给进行局部麻醉，局部麻醉分为组织麻醉和浸润麻醉。用上局部麻药以后不影响意识，能够感觉到在口内进行操作，有触感但没有痛觉。
牙烂的并不特别严重，可以进行保守治疗，去除龋坏的部分进行补牙就可以了。如果牙齿烂得比较深，而且已经伤到了牙神经，就需要进行根管治疗。取出牙神经后做一个牙冠，将剩余的牙齿套住保护起来。
拔烂牙需打麻药，如不打麻药，疼痛程度不能承受，拔烂牙根时确实会有些疼痛。目前由于麻药的进步，基本上不会出现拔牙期间疼痛的情况，如出现疼痛，可再追加麻药，一般可达到较好麻醉效果，即部分对麻药不敏感，如酗酒，可能对麻药产生耐药，此情况则会有疼痛。