可以考虑手术治疗。手术方法以显微镜下切除囊肿壁，严密缝合囊肿，以蛛网膜下腔的通道为主要治疗策略。对无症状者以及MRI显示囊肿和临床症状不明显者，一般不需要处理，可先行观察。
多发宫颈囊肿一般不严重。
如果出现了多个宫颈囊肿，并不是很严重。宫颈囊肿是由慢性宫颈炎引起的，临床上并无明显的表现，只有在做了一些妇科检查和身体检查后，才会被查出宫颈囊肿。平时要保持身体的清洁，经常更换内裤，保持同房和来月经期间的卫生，如果身体不舒适要到正规的医院进行宫颈的癌前检测。建议患者及时根据医生的嘱咐进行必要的治疗。
如果下肢疼痛，或是走路功能障碍等，可以不用治疗，如果有的话，出现了疼痛与功能障碍的，那就得需要积极的进行治疗了，可以选用手术的办法进行治疗，一次性的清除。治疗仍以显微手术为主，采用囊肿抽吸、注入药物等“微创”方式。
骶管囊肿有下腰部、腰骶部、会阴部的疼痛、麻木、酸胀，甚至会出现小便排便不尽，大便肛门周围的这种里急后重感，男性的性功能障碍，是由于骶管内脑脊液积聚，形成的一个囊肿，这种水囊对骶神经形成压迫，从而出现的一些骶神经相关的功能障碍。
宫颈囊肿又称宫颈腺体囊肿、纳氏囊肿，是慢性宫颈炎的一种表现。如无临床症状，一般不需特殊治疗。但如果出现痛经、月经不调、白带异常、腹部坠胀坠痛等症状，表明囊肿已经较大，对身体产生一定危害，需要积极治疗。对于多发但比较小的纳氏囊肿，可积极治疗并发的阴道炎、宫颈炎，囊肿会好转甚至消失；对于较大的囊肿，可考虑电刀切除或自凝刀摘除。
骶椎椎管囊肿可以用一切不开刀的治疗方法，阻止病情的发展，常用的方法有在专业医师的指导下应用中西医各种药物，针灸、推拿、牵引、正骨等综合治疗。长期坚持腰背肌功能锻炼，避免久坐弯腰，注意定期复查。
