通常对于囊肿的治疗来说，首先要彻底分清区分囊肿是属于良性还是恶性的。如果囊肿是良性的，没有必要担心了，可以通过口服一些中药进行保守治疗慢慢调养。但如果囊肿是恶性的话建议要尽早采用手术的治疗方式进行治疗，如果手术治疗方式效果不佳的话，还可以再生全身化疗的方式，这些方法就可以彻底治疗囊肿。如肾脏囊肿，若是4cm以上的肾脏囊肿，可以通过腹腔镜手术就可以治疗；4cm以下的肾脏囊肿，也可以通过B超定位下穿刺进行治疗。
囊肿不会癌变，但有些癌在病变过程中会长成囊肿。囊肿的囊壁是一层膜状结构，其内皮有分泌功能，能分泌浆液，如腱鞘囊肿、肾囊肿等，这些囊肿是良性病变，不会癌变。而在一些癌性病变，当肿块中间发生缺血坏死，坏死组织液化并被包裹，形成囊性结构，或一些恶性病变中具有一定的分泌功能的癌细胞逐步增长，形成囊性结节，就是癌性囊肿，如粘液囊腺癌。
卵巢囊肿的主要症状表现为月经失调，小腹疼痛，腹胀，腰酸，白带增多，不孕症等，囊肿大多是良性的。囊肿比较小的，对机体的各方面影响不大，不会影响生育。平时要做到随访观察，定期复查。
腱鞘囊肿绝大部分不癌变。
如果出现症状时没有得到及时正确地处理的话，就会对人造成一定的影响和伤害。这个几率是很低的。一旦发现有了腱鞘囊肿，就应该立即到专业机构做进一步检查。有这类病的人，不要心理压力过大。同时还要注意定期复查关节情况以及周围组织器官变化等。应及早到二级及以上医院骨科就诊，与医生合作积极救治，力争尽早让囊肿位置退去。此外，当病情达到减轻后，必须听医生的话，预防腱鞘囊肿的复发。
目前的情况是检查发现颅内囊肿，进一步完善相关检查。颅内囊肿是良性病变。由于囊肿生长部位不同，引起的症状也不相同。如果囊肿较小，可以暂时观察，定期复查就可以了。否则，需要手术治疗或者药物治疗。
