脑积水术后会脑萎缩的。脑积水是由额叶脑脊液过多引起的，这会导致脑内压力越来越大，我们通常称之为颅内压力过大。这样会发生心室扩大，可能压迫正常脑组织，使脑组织发生病理改变。也有一些先天性疾病，先天畸形、颅内出血或感染，可导致这种疾病的发生。
宝宝脑积水术后需积极的应用抗生素促进炎症消退，并且饮食也要主要以清淡为主，避免辛辣刺激这样有利于恢复。因为分流管的孔径小，在术中以引流管穿破大脑组织放入脑室的过程中，或是术后进行引流的过程中，可能会发生管腔堵塞的情况，脑室壁异常和腹腔壁均给以正常化治疗的方法，是治疗成功的关键。
一般情况下，脑部水肿的外科治疗分为两种。
一种是脑脊液的分流，它是用一条导流管道连接大脑和腹腔、胸腔或者大静脉，把剩余的脑脊液转移到其它的腔中进行吸收，弊端是术后患者需终身带管，可能出现管子堵塞、感染、脱落、断裂等情况。第二种是通过内窥镜检查脑室腔，清除堵塞部位，减少手术损伤。患者需要遵医嘱选择合适的治疗方式。
术后出现脑积水，需要根据CT的检查结果来决定治疗的方法，因为脑积水也是有不同的类型和轻重之分。轻度脑积水是不需要处理的，因为轻度脑积水没有什么影响，也不会引起症状。如果脑积水比较重，那就需要进行治疗。如果是因为手术以后的脑室出血所引起的梗阻性脑积水，可以通过做脑室外引流治疗。而如果是手术以后出现的交通性脑积水，可以做脑室分流手术处理，比如脑室腹腔分流，脑室胸腔分流等。
一般来说，不管什么程度的脑积水都是比较严重的，都应以手术治疗为主。具体内容如下：
解除梗阻的病因是理想的治疗方法，可采用大脑导水管成形术或扩张术，第四脑室正中孔切开或成形术，枕骨大孔先天性畸形者可作颅后窝及上颈椎椎板切除减压术等。还可常采用侧脑室颈内静脉分流术、侧脑室腹腔分流术及侧脑室心房分流术等。部分患者经过积极治疗症状可以得到缓解。
