巧克力囊肿是因为子宫内膜异位到卵巢而形成的，一般怀孕是有困难的，现在已经怀孕，如果可以，还是留下比较好。但是如果本身囊肿较大，孕期也有可能会因为受到压迫而发生扭转、破裂甚至恶变，要按时检测彩超和终究标志物。
治疗巧克力囊肿的费用大概在几百元到几千元不等，要看病人的病情轻重情况适合什么方案治疗来判断，治疗方案不同治疗费用就会有高有低，病人不能盲目治疗疾病，要是比较轻可以首先采用保守疗法治疗，中药治疗疾病有很多好处，此时花费的费用就在几百元不等，要是比较严重就手术治疗，费用大概要两三千元左右。
巧克力囊肿是由于子宫内膜异位症导致的，是因为一位的子宫内膜随着月经周期发生周期性出血，但是血液无法正常排出，所以局部会出现肿大和疼痛，囊肿内的血液因为长期不能排出呈巧克力状。巧克力囊肿一般选择的是腹腔镜手术切除，属于微创手术，术后身体恢复较快，费用2千-3千元。
卵巢巧克力囊肿是子宫内膜异位症，内膜异位到了卵巢，每个月卵巢异位灶反复出血引起囊肿，并且引起盆腔粘连。容易导致输卵管粘连，引起不孕症。手术后一般要休息一个月，在术后一个月内要注意休息，禁止性生活，所以一个月以后可以同房。
巧克力囊肿手术之后，建议如果是腹腔镜手术，建议在一个半月之后同房，如果是开腹手术，需要是两个月再有性生活。由于巧克力囊肿具有复发性，所以术后要继续给予用药治疗。
卵巢巧克力囊肿是由于子宫内膜异位到卵巢上生长而导致形成，会引起进行性的痛经，甚至是导致不孕。切除手术以后，禁止同房和盆浴一个月，以免由于过早的同房和盆浴导致引起盆腔的感染，同时还要禁止做重体力活动，饮食清淡才行。
