两者最大的不同在于过敏性咳嗽只是咳嗽感受器敏感性增加，病变通常不累计气管支气管，咳嗽虽剧烈，但往往不会出现气紧的表现，气道反应性不高，肺功能通常是正常的。而咳嗽变异性哮喘则不同，咳嗽变异性哮喘本质仍然是哮喘，也可认为是轻度哮喘，病变累及气管、支气管，肺功能会有异常，气道反应性明显升高，在咳嗽时往往有气紧的情况。
过敏性咳嗽是一种通俗的说法，在临床上是没有这个诊断的，咳嗽变异性哮喘是一个医学上的诊断，是慢性咳嗽中的一种，是支气管哮喘的一种特殊的形式。那么它形成的原因就是过敏原因导致的气道的高反应，以及气道的慢性炎症，从而出现的以咳嗽为主要表现的症状。所以说咳嗽变异性哮喘，也就是一种过敏性的咳嗽，两者都是过敏引起的。
一般情况下，儿童变异性哮喘，具体的药物使用要根据实际情况和医师的面谈来进行。具体分析如下：
儿童仅有的症状是反复的咳嗽，不伴有喘气，多见于晚上和锻炼后。其呼吸道炎性反应与支气管哮喘相似。胸部听、胸部CT均未发现异常，而肺舒张试验则呈阴性。可以通过诊断，使用布地奈德、运用顺尔宁等进行雾化吸入。如果孩子在服用药物后出现了明显的缓解，应该是咳嗽变异型的。变异型支气管哮喘的处理方法和支气管哮喘一样。如果不及时的处理，很有可能会导致儿童出现气喘。儿童变异型哮喘要尽量远离恶劣的生活条件，要以清淡的食物为主，并要适时地增加衣服，以免感冒。
变异性哮喘是特殊的哮喘类型，小儿推拿有一定的效果。
它唯一的或者说主要的症状是咳嗽，没有明显喘息气促的症状，有气道高反应性，多数是咳嗽持续发生或反复，导致病情迁延不愈，引发咳嗽变异性哮喘。清肺经是小儿推拿常用穴位，清肺经和运内八卦分别按大概3分钟。用手掌擦肩背、胸部，肺俞、膻中部位是重点，擦热然后再搓，斜肋10-25次，按丰隆穴大概3分钟，痰多的延长推拿时间，捏脊6-8遍。
咳嗽时间长了，就容易诱发哮喘病了。有的是感染因素引起的，再加上过敏因素，也容易诱发这种病。需要适当的用止咳类的药物和平常类的药物缓解情况，如果病情比较厉害，就要吸氧缓解。又要花钱检查，根据检查的情况治疗，一般是药物治疗，结合小儿推拿疗法，避免吸入有害气体。
孩子变异性哮喘和过敏因素，导致的哮喘是有直接关系的，应该给孩子去医院检查一下过敏原，确定过敏原以后避免接触，平时可以口服药物，雾化吸入糖皮质激素预防急性发作，急性发作时可以雾化吸入特布林，异丙托溴铵治疗缓解症状。