神经性头痛在临床上非常常见，有时候给患者带来很大的痛苦，影响正常的工作和生活。根据不同的诱发病因，治疗也不同。中枢神经系统感染，常见的有病毒感染、细菌感染等，可以导致脑膜炎、脑炎引起头痛。需要给予脱水降颅压、抗病毒、抗感染治疗。脑血管病，脑梗死和脑出血都可以引起神经性头痛的后遗症，可以给予药物口服。
神经性头痛要找到病因，可以用中医中药的办法治疗，也可以用现代西医的办法，比如一些营养神经的药物，也可以改善脑膜的通透性的药物，可以改善头晕、头痛的症状。如果用中医的办法，可以考虑用一些疏风的、止痛的、活血的药物进行治疗。
头痛发作时可适当服用止痛药，平时要保持良好的睡眠、不宜长时间看电脑或电视，经常按摩头颈部可减少头痛发作，少吃辛辣及油炸类食物，控制好自我情绪，避免生气，并进行脑血管的造影等检查。
临床上治疗可以用高流量氧气吸入来缓解血管扩张所带来的头痛，同时还可以用钙通道调节剂。同时配合针刺松解紧张肌肉筋膜链，使肌肉筋膜链放松后对血管的压迫缓解以起到缓解头痛的目的。
神经性头疼的综合物理疗法治疗包括电针灸疗法、神经肌肉电刺激疗法、电兴奋疗法、经络导平治疗以及按摩推拿医治等。放松疗法作为药物医治的辅助疗法，是通过主观想象和客观措施，使人达到肌肉松弛精神安定减轻焦虑的方法。放松疗法作为一种减轻焦虑的心理行为医治的重要组成部分，可明显的缓解精神因素造成的各种神经性头痛、偏头痛、失眠症、焦虑症、抑郁症、神经衰弱等。
