扁平疣是由HPV中的亚型感染引发的一种皮肤良性增生，主要病毒类型为HPV2、3、4等，虽然具有传染性，但不会引发癌变。扁平疣的治疗方法主要有食疗、手术治疗和外用中草药治疗等方法。其中中草药治疗比较安全可靠。
扁平疣和宫颈HPV两者无确切的关系，抵抗力低了防护措施不到位引起的病毒感染，积极治疗就行。HPV检查主要是对尖锐湿疣确定的，患部在阴部的话有可能换了尖锐湿疣的，其实扁平疣和尖锐湿疣都是人类乳头瘤引起的，治疗也可以用同一种药物的。
HPV会引起扁平疣，也会引起寻常疣，疣状表皮发育不良，以及宫颈癌等病变；这个病毒很顽固，目前并没有能直接杀死这种病毒的药，只能通过增强免疫力；但很多人用了很多增强免疫力的药照样没用的；原因是这个病毒本身具体伪装功能，能降低局部的免疫力，让人体免疫系统发现不了它。
扁平疣是一种病毒性皮肤病，它的病原体和寻常疣一样，是由乳头状瘤病毒HPV3和HPV5感染引起的皮肤赘生物，很少会通过患者的接触和性生活传染的，可以在同房前双方清洗外阴，注意卫生来避免。
人类乳头瘤病毒的药物一般分为外用药物和内服药物。
1、外用药物：人类乳头瘤病毒的患者可以在医生指导下外用鬼臼毒素酊，咪喹莫特乳膏，氟尿嘧啶软膏等药物进行治疗。
2、口服药物：人类乳头瘤病毒混者可以遵医嘱服用清热解毒片、苦参片、阿昔洛韦片、利巴韦林片等药物进行抗病毒治疗。
乳头瘤病毒39型阳性，说明感染了；目前没有特效的抗病毒药物，治疗必须采用综合治疗。提高机体免疫力，应用抗病药物。一般只要坚持规则的综合治疗都可治。还有手术疗法、冷冻疗法、激光治疗、电灼治疗、微波治疗、微波手术治疗等。
