副作用是可以岀现恶心呕吐的现象，还有可能导致头痛或者是腹泻。少数人服用后会出现药物性身体发热的现象，还可以因为这种身体发热而导致头晕。也可能出现皮疹肛门瘙痒，也可使得服药者产生溶血性贫血，甚至有可能诱发黄疸或者是导致神经性炎症。
服用头孢期间不服用藿香正气水，因为藿香正气水中含有40-50%的酒精。更换不含酒精的藿香正气口服液。一定要吃，头孢可放在饭前半小时，易吸收，效果好，藿香放在饭后半小时。
呋喃唑酮是抗菌类药物，主要缓解幽门螺旋杆菌感染。成人口服一次0.1g，一日3-4次，儿童按体重一日5-10mg每千克，分四次服用，肠道感染疗程为5-7日。服用该药物期间，禁止喝酒，以免出现严重过敏反应，服用药物后，还会出现恶心呕吐、头晕头痛、溶血性贫血等不良反应，该药物不能长期服用。服用药物期间，多注意饮食习惯的调理。
口服这类药物以后身体出现浑身发热，头痛的临床表现症状，可能是药物反应等因素有关主线的临床表现，可以通过调整药物等方法进一步治疗当身体服用中药进行调理治疗身体的时候，身体出现了不良反应，可以调整其他药物进行规范性治疗。
霍香正气水和酒同服是有很大危害的。两者相用对于祛除患者的相关症状包括头晕、恶心、呕吐、周身乏力等等没有任何好处。反而会使病情加重，特别是使醉酒加重使患者呕吐不止、狂躁甚至出现痉挛，降低人体的免疫力，还会诱发感染。
怀孕最好不要吃藿香正气水。
孕妇在怀孕初期最好不要服用药物，因为孕早期是胎儿发育的重要阶段，如果用药不当，可能会影响胎儿的正常发育，严重的还会导致胎儿发育畸形的情况。如果孕妇在怀孕期间患有感冒，可以先通过多喝热水进行改善，不可自行用药，如果症状仍得不到改善，可以前往医院进行检查，在医生指导下正确服用药物进行治疗。
