在治疗上应该采取积极的手术治疗，把原发性肝癌的位置进行切除。如果手术不耐受，身体条件比较差，心肺功能又比较差，可以配合中药的巩固治疗。中医对肝内胆管切除以及不能耐受切除的病人都是有很好的作用，可以杀灭血液中残留的肿瘤细胞，还可以通过介入导管的灌注化疗。
一旦发现肝内胆管癌，常处于中晚期，只有少数能达到根治性切除，部分患者做手术切除不彻底，只能达到姑息性切除，还有部分患者由于发现肝内胆管癌已在腹腔内播散，无进行根治性切除。所以肝内胆管癌切除率较低。肝脏手术属于高风险手术，容易出现出血、术后肝功能衰竭等严重并发症。一般手术死亡率可以控制在3%以下，术后并发症的发生率一般可以控制在30%以下，多数患者通过手术能够康复出院。
黄疸，腹痛，可能有胆道出血的情况，晚期癌肿破溃和出现胆道的出血，破入肠道，出现黑便，便中隐血。皮肤的瘙痒，皮肤瘙痒可出现在黄疸的前后，主要是血液中胆红素的含量增加，导致皮肤的瘙痒。可能出现一些转移的情况，转移到肺，呼吸可能不太好。
肝胆管癌手术比较成功，患者的生命也会有所延长，大概可以多活几年，呈现恶化的情况，那么很有可能会缩短患者的寿命，有可能只能活2～3年，肝胆管癌手术后应该要进行放疗的巩固治疗，这样才可以控制病情的发展。
肝内胆管癌是可以治愈的，但是前提是坚持早发现、早检查和早治疗的原则。治疗肝内胆管癌最常见的方法是外科手术治疗，这类方法治疗效果较好能够明显的延长患者的生存期，而且复发率不高，甚至可以治愈。如果肝内胆管癌患者病情已经发展到了晚期则不适合手术治疗，可以进行化学药物治疗，该治疗方法是延长患者生存期的可能途径。
肝内胆管癌是不容易治疗好的。手术切除是肝内胆管癌的首选治疗方式。手术的范围要看患者的癌肿部位以及癌肿的大小，通常手术方式包括左右半肝切除术、肝叶的部分切除术，以及肝段部分切除术等。
