治疗乳腺导管瘤的手术方式很多，主要包括区段切除术、象限切除术、皮下乳腺切除术或单纯乳房切除术。具体的手术方式选择，主要根据病变的性质、病变的范围和精确定位而定。术中同时需要进行快速病理切片检查，确定病理诊断。近年来随着乳腺导管镜在临床诊断的应用，使手术方式趋向微创化发展，有效的缩小了手术切除的范围。
乳腺导管瘤多采取手术治疗的方法，以切除肿瘤或者是病变的导管，也可以行药物治疗，要避免焦虑，烦躁。其次由于本病有恶变的可能，术后每隔三个月就要定期去医院复查一次。饮食必须清淡，高蛋白，富含维生素，避免摄入过多油腻，煎炸等食物。
乳腺导管内乳头状瘤是发生于乳腺导管内皮的良性肿瘤，多见于经产妇，75%的病例发生在大乳管，乳头的壶腹部，瘤体很小，带蒂且有绒毛，并且有很多薄壁的血管故意出血。发生在小乳管的乳头状瘤常位于乳房周围的区域。发生在大乳管的乳头状瘤，较大者可触及。一般无明显临床表现，常常因为乳头溢液而污染衣物而引起注意。溢液可为血性，暗棕色或黄色液体，瘤体较小，不易察觉，偶尔会出现较大的肿块。
比较严重，乳腺导管瘤的病症，位于乳晕周边，大多数导管的乳头状瘤。而乳腺导管内乳头状瘤为女性常见的乳腺良性肿瘤，具有一定的癌变率，常以乳头溢液为首发症状，但其临床表现缺乏特异性，不易与其他疾病鉴别，早期诊断具有一定困难。治疗上有赖于准确的定位、定性诊断，如果手术切除不彻底，将存在复发和一定的恶变概率。
这个原因有很多，内源性或外源性雌激素的长期刺激雌激素的活性对乳癌的发生有重要作用，致癌性RNA病毒可能与乳腺导管瘤相关。乳腺导管瘤在家族中的多发性也获得证实。具有乳腺导管瘤家族史的女性，发生乳腺导管瘤的危险性是正常人的2-3倍。
乳腺导管瘤需要手术治疗。对于单发的导管内乳头状瘤，切除病变的乳腺导管系统及周边的乳腺组织就可以，术后需要进行病理检查，如果有恶变需要进行乳腺癌手术。如果是年龄比较大，导管上皮增生活跃的病人，可以单纯进行病变侧乳房切除术。