大约2000左右，在一般的三甲综合医院，脑组织的磁共振增强费用包括行磁共振扫描的费用，增强用药的费用以及高压注射器等注射用材料的费用等几部分，脑部的增强脑灌注检查可能也是需要2000多块钱。
脑部核磁共振没有电离辐射，对人体没有放射性的损害。其中脑部核磁共振是利用人体内氢质子，在磁场中产生共振信号来获得的图像。脑部的核磁共振对颅内的检查能够更精确，同时脑部核磁检查不会出现颅骨的伪影，也不需要造影剂，就能够清楚的显示头部冠状位、矢状位等图像。
脑部的检查可以选择做CT或者是核磁共振，各有其优缺点，针对脑梗塞的病人，核磁共振优于CT，因为核磁共振能够发现超早期的梗塞病灶，而6个小时以内的梗塞病灶，在CT上是不显影的，所以针对脑梗塞的病人，核磁共振是优于CT的。要是针对脑外伤的病人，就会选择CT多一些，因为CT检查时间快。
儿童做脑部核磁是没有什么伤害的，因为影像学检查中有辐射的是头颅ct，X线。核磁只是利用磁场来进行检查的，跟射线是没有关系的，所以没有放射性危害。噪音大，这一点来说对孩子会造成一些不适。
核磁共振检查时间一般在10~30分钟。检查时间和检查部位、检查方式、机器设备有关。头颅、颈椎、腰椎相对比较快，一般10分钟左右就够了，比如颈椎病、腰椎间盘突出等检查比较快。腹部、盆腔相对比较慢，比如怀疑肝脏、肾脏、胰腺、子宫、前列腺等，一般要20分钟左右，如果是增强检查，时间要更长。
脑部核磁共振检查没有明确的副作用，因为基本原理是探测人体组织内蕴藏量最丰富的氢离子，在磁共振过程中发出电磁波信号测出氢离子浓度及其驰豫时间，作为成像的参数。