脑炎的后遗症主要有：1、脑炎累及人体运动神经，引发运动功能障碍，导致四肢无力、活动能力受限的后遗症；2、脑炎发病部位本来就属于大脑，因此更容易损害大脑神经引发智力障碍；3、疾病累及语言神经，引发失语后遗症；4、眼球麻痹也是脑炎的后遗症之一，由于这种疾病也容易让视觉神经受损；5、脑炎也容易引发肌肉萎缩的后遗症。
不手术的话会有很多后遗症的，首先神经系统会损害，会出现、语言反应迟钝、肢体瘫痪、吞咽异常困难、视神经萎缩导致失明、癫痫等症状。会有认知功能障碍，有痴呆、记忆力衰退。
手术治疗：手术治疗在小儿脑炎后遗症患儿的临床治疗中占有重要的地位。在各种非手术治疗无效时,手术就成为重要手段。心理治疗：受病情影响，严重影响病情治疗，所以心理治疗很重要。
脑炎后遗症一般不会自愈，一定要掌握一些治疗的方法，要针对不同的后遗症表现，采取相应的治疗，综合治疗是比较好的办法，可以在服药期间做一些有氧运动，对于治疗有好处。
一般是脑炎在经过急性期的积极治疗后，留下不同程度的功能障碍，是由各种病毒引起的一组以精神和意识障碍为突出表现的中枢神经系统感染性疾病。可以去正规的三甲医院诊断治疗。