肥胖症男孩可能会影响睾丸发育，建议维持在正常的体重。
过度肥胖会影响孩子的内分泌系统，会降低孩子的雄激素，会造成睾丸阴茎等生殖器官的发育不正常，同时还会影响到孩子的生育器官的成熟度。
肥胖会导致儿童体内的脂肪组织增加，导致机体的代谢耗氧量增加，导致儿童发生脑血管疾病，如心绞痛、高血压、冠心病等，因此需要及时控制。
16岁的男孩子体型比较肥胖，应该与内分泌也是有一定的联系的，但是关键的还是高热量食物的摄入，以及运动量的减少，所以内分泌的激素也是不稳定的，多吃新鲜水果蔬菜，有利于体重的减轻并且逐渐的增加运动量来消耗脂肪。去医院检查一下激素六项，是不是内分泌失调造成的。
家长要给孩子制定一个长期减肥计划，因为单纯性肥胖减肥是一个长期慢长的过程，不可能短期内见效，只有持之以恒，一步一步走下去才能达到最终的目标。然后控制孩子的饮食，应该在减量上做到循序渐进，切勿操之过急，一方面心理压力也太大。所以家长一定要注意要循序渐进，尊循持之以恒的原则。孩子在减重期间一定要关照孩子的心理健康状态，不要给孩子盲目施压。
生殖器短小也许是因为肥胖造成的，可以通过减肥来进行治疗，如果减肥以后阴茎还是发育短小，孩子还小，可以通过补充雄性激素来促进阴茎的发育。平时注意适当锻炼。可以吃一些热量比较低的食物。
儿童肥胖症，尤其超重20%以上的中度或重度肥胖症可并发一系列代谢综合征，主要包括以下几方面：高脂血症，可出现于大部分肥胖儿童；高血压病，儿童肥胖可直接导致高血压；冠心病，肥胖可造成心肌损害。