先天性心肌桥治疗主要是通过药物治疗和手术治疗。另外是采集手术，有两种术式即心肌桥切除术及冠状动脉搭桥术。心肌桥是一种先天性的冠状动脉发育异常，容易引起心肌缺血。心脏收缩时被心肌桥覆盖的这段冠状动脉受到压迫出现收缩期狭窄引起心肌缺血，出现心悸、胸闷气短、心前区不适或闷痛。
室间隔缺损小于0.1-0.3cm时没有任何临床表现其不需要特殊治疗，在1岁半左右可以自行修复。对于缺损比较严重的患儿采用介入治疗和手术治疗，药物治疗可以积极地防止感染性心内膜炎的发生，也可以防止心力衰竭的发生。进行手术治疗需要择期进行，最佳手术年龄在3岁左。
心脏病室间隔缺损饮食禁忌是应避免一切含有辛辣刺激性的食物，如酸辣过冷，过烫，葱蒜，以及豆类制品等胀气食物，还有粗粮和富含渣滓的食物等，其次应该采取少吃多的方式，目的是中和胃酸。
先天性心肌肥厚吃的食物需要根据病人自身的状况来进行判断，在平时的生活中可以多吃一些新鲜的蔬菜跟水果，多补充一些维生素，在治疗期间要注意劳逸结合，避免过度劳累造成身体负荷，平常的饮食要以清淡为主，少抽烟少喝酒。
通常情况下，先天性胎儿有心室间隔缺损，一般会在一年之内自动关闭。具体内容如下：
但是如不能自己封闭，或是单纯的二孔导致先天性心脏缺损，应做外科治疗，4~5岁是最好的选择。尽早进行外科治疗，可以避免肺部的循环阻力增高，避免右心功能衰竭。此外，宝宝还需要进行一次心脏的超声检测。如果没有明显的扩大，或者低于6mm，可以不做手术。患儿要饮食清淡，多食新鲜蔬菜、水果，补充维生素，提高身体免疫力。营造舒适、安静的休息环境，定期通风，保持室内空气新鲜，避免上呼吸道感染。
如果经检查证实为先天性心脏病，由间隔缺损或房间隔缺损引起，及时进行外科修复治疗一般具有积极意义。此外，有必要及时判断是否有肺动脉高压。如果有肺动脉高压，有必要及时控制肺动脉高压，以避免由这种高压引起的心力衰竭。