到医院的生殖感染科就诊，基因芯片检测系统可以对感染的病原菌进行准确的定性定量分析，以明确诊断，以免病情延误。如果确定是生殖器肉芽，需要做激光手术治疗，尽快治疗好，避免传染。
生殖器疱疹治疗方面，主要是保持局部的清洁、干燥，可以每天用生理盐水来进行清洗，疼痛者可以口服止痛的药物，并给予精神安慰，并发细菌感染者可以外用抗生素药膏来涂抹治疗。还可以抗病毒药物的治疗。
生殖器肉芽一般考虑是珍珠疹，这是一种正常的现象，可以不用治疗。但是如果存在不洁性生活，生殖器长肉芽考虑是尖锐湿疣、生殖器疱疹的可能要更大，这是比较常见的性传播疾病，需要及时进行抗病毒治疗。
生殖器上长肉芽和肉粒都是尖锐湿疣的典型特征。尖锐湿疣是日常生活中常见的一种疾病，该疾病传染性强，复发率高，当夫妻的一方患尖锐湿疣，另一方被传染患病的机会，也会变得非常之高，所以要注意隔离和个人卫生。
尖锐湿疣的危害不仅仅是身体的，还有对病人的心理有一定的打击，严重的危害到家庭的幸福，还是要抓紧时间治疗的！尖锐湿疣不是不治之症，是完全可以治好的，其治疗目的主要在于清除表面湿疣的同时消除其潜伏的亚临床症状及所含病毒，不用做手术不激光通过用药以后清除体内病毒疣体会自动萎缩脱落，没有疼痛也不会留下令患者终身难堪疤痕。
生殖器要是长肉芽，严重就是尖锐湿疣在潜伏期的时候，很难发现，无法诊断，还有尖锐湿疣在发病之前，因为这时的尖锐湿疣还没有任何反应，就察觉不出来，因此，只有靠细心观察，发现蛛丝马迹，尤其感觉身体出现了变化，不要忽视自己身体上的一些细节变化，然后进行适当的检查，就可以提早检查出来。