一般不影响。肛瘘是发生在肛门直肠周围的脓肿溃破或切口引流的后遗病变。是属于肛肠系统的疾病，性生活一般是不通过肛门的，除非是肛交，对于正常的性生活是没有影响的。
肛瘘常有肛周脓肿自行溃破或切开排脓的病史，此后伤口经久不愈，成为肛瘘外口，主要症状是反复自外口流出少量脓液，污染内裤，有时脓液刺激肛周皮肤，有瘙痒感，若外口暂时封闭，脓液积存，局部呈红肿，则有胀痛，封闭的外口可再穿破，或在附近穿破形成另一新外口，如此反复发作，可形成多个外口，相互沟通，如瘘管引流通畅，则局部无疼痛，仅有轻微发胀不适。
肛瘘不做手术会有流脓和流水的现象，可能会发生反复的感染或者出现疼痛等局部症状。肛瘘是一种慢性炎症性疾病，如果长期得不到医治，在慢性炎症的不断刺激，会出现恶变倾向。
低位复杂肛瘘疾病容易复发，所以要注意坐时要让肛门处于悬空状态，便后用水清洗肛部，可以在医院买个电动肛门护理包，里面有肛部清洁器帮助便后清洗，肛部药浴盆放在马桶上熏蒸坐浴，坐姿时用肛部支撑垫帮助悬空伤口，促进水肿消退。
括约肌与肛瘘是连在一起的。括约肌分为肛门内括约肌以及肛门外括约肌，在做肛瘘手术的时候有可能会受到影响，甚至会导致括约肌功能下降，就会导致排便困难，期间可以根据症状来判断到底是严重的还是轻微的，有些症状可通过做提肛运动得到恢复，后期需要改变大便习惯。