肛肠科的疾病手术后，都是非常疼的，尤其是在换药的时候，疼痛比较剧烈的，疼痛也是与个体耐受力有关系的。术后注意避免久坐，定时换药。保持个人清洁卫生，养成定时排便的好习惯。
非手术治疗：包括热水坐浴、通便、理疗，有急性炎症可菌培养后应用抗生素。非手术疗法只适用于反复发作的脓肿初期以及手术前准备，但不能彻底。手术治疗：挂线疗法或手术切除。肛瘘都有内口，切开或切除内口是肛瘘的关键。明确内口，加以处理，才能治肛瘘。避免复发。
低位肛瘘手术可以门诊手术，术后7到10天左右可以恢复。术后恢复多久还要看伤口和采用手术的方法，饮食要多喝水，多吃水果蔬菜，香蕉，苹果，猕猴桃，火龙果，芹菜，菠菜，木耳，蘑菇，冬瓜等，少吃辛辣，海鲜，辣椒，牛羊肉等。排便时间不宜过长控制在3到5分钟即可，平时不宜久蹲久站久坐，排便后有温水清洗肛门。
鉴别高位肛瘘和低位肛瘘要看肛瘘的位置偏高或偏低，高位肛痿与低位肛痿的区别在于，高位肛痿是指痿管已经达到坐骨直肠间隙，或者骨盆直肠间隙。低位肛瘘是指瘘管的位置比较浅，多在括约肌间隙，皮下脂肪间隙，或者肛门后间隙。两者手术方法不同，高位肛痿手术比较复杂。高位肛瘘一般比较复杂，通常可能有2-3个甚至更多的外口。低位肛瘘通常只有1个外口。
应该是注意休息一周的时间的。去医院复查，排除创面感染，假性愈合，水肿等情况后，建议可以每天用热的淡盐水肛门坐浴熏洗10分钟，来预防感染的发生及促进创面的愈合，保持大便通畅，不要干燥和腹泻，禁止吃一些辛辣刺激的，酒，海鲜类的食物。
肛瘘伤口的愈合情况，还需要看肛瘘的具体病情，一般肛瘘手术后7-10天可以正常生活，肛瘘的伤口在1到2个月会逐渐愈合。低位肛瘘手术之后创面出现炎症和肿胀的可能性比较大，所以需要病人注意日常的清洁卫生和饮食调理，避免需要进行二次手术。