肛瘘囊肿手术住院时间大约需要一周到十天左右，出院以后，会有一些局部的不舒服，以及要定期去换药，需要在家休息一段时间，暂时是不能上班的，具体时间还要看疾病恢复的程度。
肛周囊肿手术之后没有完全治好或者是手术出现了失败是有可能出现肛瘘，但是这种现象发生的几率不是非常大，术后需要养成定时排便的习惯，避免大便干燥。饮食宜清淡，容易消化，少渣滓，以免排粪次数增多。有习惯性便秘或排粪不畅的病人，平时要多食含纤维素多的蔬菜，水果，保持粪便柔软，排便时不要太用力或蹲厕过久。
肛周囊肿及时治疗不会形成肛瘘的，皮脂腺囊肿俗称粉瘤，就是毛孔堵塞导致分泌的油脂类东西堆积形成包块疙瘩。一般容易导致感染发炎。建议在没有感染的时候手术切除以绝后患。肛瘘是肛门周围局部组织感染发炎形成脓肿，正确治疗不会形成肛瘘。
这段时间饮食需要清淡，不能吃辛辣刺激性的食物，需要多吃新鲜蔬菜和水果，避免干燥。有囊肿肛瘘是需要通过手术来治疗的，用药是没有什么效果的，因为本身已经肛瘘里面都是脓了，必须切开，排出来之后才能完全治好的，所以现在需要去医院检查。
肛周皮脂腺囊肿及时治疗不会形成肛瘘的，皮脂腺囊肿俗称粉瘤，就是毛孔堵塞导致分泌的油脂类东西堆积形成包块疙瘩。一般容易导致感染发炎。建议在没有感染的时候手术切除以绝后患。肛瘘是肛门周围局部组织感染发炎形成脓肿，正确治疗不会形成肛瘘。
肛周囊肿多数一会形成肛瘘，平时要保证自己不要便秘，因为粪便干燥会加重肛周病变程度，因此一定要多吃蔬菜水果、多喝水，避免便秘。要保持局部的清洁干燥，勤换内裤，必要的时候可以采用卫生巾的方式来短暂性缓解，饮食上避免辛辣刺激性的食物。