一般来说，男性生殖器真菌感染可以选择药物治疗。
男性生殖器官被真菌感染的一种疾病，可以采用局部用药，先用碳酸氢钠溶液清除龟头前方的分泌物，保持局部清洁和干燥，然后可以外用一些抗真菌药物，如克霉唑乳膏、硝酸咪康唑乳膏等。重度的病人可以服用氟康唑片等药物。同时要注意个人卫生，每天晚上要清洗龟头，经常更换内裤。
一般来说，男性生殖器真菌感染用抗菌药。
如果是男性外阴真菌感染，可以使用抗菌药物。最常见的是克霉唑胶囊和特比萘芬片，局部可用5%碳酸氢钠外洗，也可以外用高锰酸钾，也可以外用克霉唑软膏、硝酸咪康唑软膏。一般情况下，口服和外用的药物都要使用4-6个星期。真菌的治疗很难，需要很长的时间，需要持续的治疗。如果局部瘙痒，也不能用手抓，否则会造成交叉感染。
男性生殖器真菌感染一般是龟头和包皮的真菌感染，通常见于包茎或者包皮过长的患者。通常的症状可以见到阴茎头、包皮内板或者冠状沟处，也就是把包皮翻起来以后可以看到大量的、黏稠的、豆腐渣样白色污垢，洗干净了以后可能很快就会再次出现。另外可以看到阴茎头、冠状沟和包皮内板红肿，并且有红色的丘疹，有些患者会看到感染的皮肤和正常的皮肤有明显的分界线，会出现皮肤瘙痒，这种痒非常难以忍受，而且会有烧灼感。建议患者及时去医院就诊，明确具体情况，对症治疗。
阴囊真菌感染后一般会有阴囊皮肤痒，表面有很多皮屑，甚至很多有白色膜状物。对于阴囊出现真菌感染应该每天清洗干净，保持干燥，局部可以涂抹抗真菌的药物进行治疗。
真菌感染会导致生殖器和龟头表面有红肿痒，甚至有白色分泌物的现象，可以到皮肤性病科，检查阴茎和龟头上的脱落细胞，这样才能做出一个明确的判断，做细菌培养以后，有针对性的选择抗真菌的药物，一周左右恢复正常。
阴囊真菌感染可能会自愈。
若是存在真菌感染的情况，阴囊真菌感染有可能是长时间的待在闷热的环境内或是衣物不透气所引发的。患者需要及时的配合医生选择药物进行治疗。如果没有及时的处理，如果没有及时的处理，很有可能会反复发作，需要用药来进行治疗，避免发生相互传染，同时还要注意个人的卫生。
