长期不治疗会导致癌变。肛瘘初期的时候产生的危害并不大。但是时间一旦加长，将会产生很大的伤害，肛瘘如果长期不采取治疗措施就会危害到身体，甚至还有可能导致癌变的可能性。
肛瘘是可以出现流血现象的，但是并不严重，因为流血的量并不多，并且经常与脓液一起排出。肛瘘是由位于肛周皮肤的外口以及直肠内的内口，以及连接于两者之间的瘘管所组成。由于瘘管引流通常并不通畅，瘘管内的不健康肉芽组织发生缺血、坏死，可以导致出血，并且与脓液一起从瘘管自外口排出。
肛瘘流血为一种疾病，亦为一种症状，肛瘘流血主要出现于肛瘘的中期与晚期。肛瘘流血的情况主要为肛门周围存在的一些小包，红肿、破溃导致。肛瘘的早期可出现流脓，因为肛瘘主要因脓肿导致，当脓逐渐排干净之后，再长好之后，那么下次还会出现此类情况。到中晚期之后，就很少有脓液流出来，流出的一般为脓与血的混合物，或者单纯的出血。
流脓：脓液多少与瘘管大小、长短及数目有关。新形成或炎症急性发作期的瘘管脓多、味臭、色黄而浓厚，经久不愈的瘘管脓液较少或时有时无。脓液急剧增多，局部脓肿，体温增高。常因肛瘘炎症急性发作或有支管形成。结核性肛瘘脓液多而清稀，呈米泔水样，可有干酪样坏死物。肿块：肛缘索条状硬块。
如果大便出血经常发生，检查后考虑肛瘘，应考虑大便干燥或便秘引起的肛裂和最终感染引起的肛瘘。应注意饮食习惯的季节性调整，尽量吃一些清淡易消化的食物，多吃蔬菜和水果，养成每天排便一次的习惯，防止便秘。如果病情较严重，应在医院进行进一步检查或手术治疗。