对于肺脓肿的病人，在病情稳定的情况下，可以口服抗生素。口服抗厌氧菌的药物有：甲硝唑、替硝唑、奥硝唑等；还可以选用红霉素等肺部军团菌感染的脓肿，也可以选用阿奇霉素。
阿奇霉素口服的时候，一般都是服用三天，然后停用四天，因为阿奇霉素的药效会持续很久。肺脓肿患者有痰多，可以口服复方甘草合剂、氨溴索口服液等化痰药物。
小儿的脑脓肿平常多食用可增加免疫功能的食物，如香菇、香菇等，不要吃冷饮食物，以免加重病情。脑脓肿的治疗包括内科或外科两种疗法，要根据病情来分别治疗。真菌或蠕虫脓肿，病人对药物治疗无效的要进行外科治疗。病情稳定，无严重颅压增高的体征以及脓肿大小在2到3cm以内的要做内科治疗。
要想一次根治肛周脓肿，应在肛周脓肿形成早期切开，减低局部张力，以阻断其扩散和向四周的蔓延；在脓肿清创时，应切除病变的肛隐窝，在脓肿切口位置选择准确后，利用hcpt技术进行根治。
该肛周脓肿主要由肠道细菌进入肛窦并扩散至肛周间隙引起的肛腺感染引起。一旦肛周脓肿形成，服药不能减轻肿胀，但需要手术治疗。一旦形成，应在医生的指导下及时进行手术，并积极进行抗感染治疗。平时，要注意肛周卫生，避免便秘，不要坐太久，养成良好的排便习惯。
表浅脓肿可选择口服抗生素来治疗。切开排脓属于暂时性应急处理。可排出脓液，迅速减轻症状，但不能代替手术，一般约需3个月左右，待瘘管形成，内口明确，再行手术。平时注意饮食清淡，忌食辛辣刺激性食物，多吃新鲜蔬菜水果，多喝水。
肛周脓肿吃抗生素比较好。肛周脓肿是肛肠科的急重症，需及时治疗，只有很少数肛周脓肿病人用抗生素，热水坐浴及局部理疗等可以消散，但大多数都需要手术治疗，深部肛周脓肿须尽早手术。