甲状腺过氧化物酶抗体升高通常提示为自身免疫性疾病，常见于慢性淋巴细胞性甲状腺炎，又称桥本甲状腺炎。
桥本甲状腺炎伴甲状腺功能亢进时，应根据患者甲状腺功能亢进情况给予抗甲状腺药物。伴甲状腺功能减退时，应根据甲状腺功能减退情况给予优甲乐治疗，并根据甲状腺功能检查结果调整药物剂量以保持甲状腺功能正常。桥本甲状腺炎进展缓慢，可能出现较长静止期，即使桥本甲状腺炎甲状腺功能正常，也建议每6个月定期随访并复查甲状腺功能。请注意，自身免疫性疾病，如1型糖尿病和艾迪森症，也会导致甲状腺过氧化物酶抗体升高。孕妇孕检发现甲状腺过氧化物酶抗体升高，应及时到内分泌科就诊。
抗甲状腺过氧化酶抗体高很可能是由于淋巴细胞性甲状腺炎造成的，淋巴细胞性甲状腺炎实际上又名桥本甲状腺炎，这种疾病很有可能会对病人的甲状腺造成严重的伤害。
抗甲状腺过氧化物酶抗体高是因为免疫系统有错误，抗甲状腺过氧化物酶抗体高的临床诊断为桥本氏甲状腺炎，也就是慢性淋巴细胞性甲状腺炎。
产生抗甲状腺过氧化物酶抗体意味着身体中会发生自身免疫防御反应，抗体不会损伤甲状腺，因为自身免疫炎症导致的甲状腺增大往往最终缩小。甲状腺不断破坏、损伤，需要合成分泌甲状腺激素不足身体时，甲状腺功能减退。桥本氏甲状腺炎确诊后行甲状腺超声诊断，无高恶性风险结节，无甲状腺功能异常，无需特殊治疗，定期复查，每年仅行甲状腺功能检查一次。如果出现甲状腺功能下降，用左甲状腺激素钠替代治疗维持甲状腺功能正常，不需要特殊的饮食和药物注意。
抗甲状腺过氧化物酶抗体高，在多种自身免疫性甲状腺疾病中，都会出现升高，但是其升高的程度是不一样的。如果升高比较明显，要首先考虑自身免疫性甲状腺炎，比如桥本甲状腺炎。如果是轻度或者中度程度的升高，则考虑甲亢等疾病。所以甲状腺过氧化物酶抗体的水平，可以与其他甲功指标综合评估甲状腺疾病的病因。
甲状腺抗过氧化物酶抗体升高，提示以下几点。
第一，自身免疫性甲状腺疾病，如桥本甲状腺炎、毒性弥漫性甲状腺肿，也就是Graves病。
第二，其他自身免疫性疾病也可表现为甲状腺抗过氧化物酶抗体升高，如类风湿关节炎、系统性红斑狼疮。
甲状腺抗过氧化物酶抗体主要是甲状腺细胞受损后，细胞内甲状腺过氧化物酶进入血液，刺激机体产生自身免疫性甲状腺炎的标记抗体，与甲状腺球蛋白抗体的临床意义相同，但甲状腺过氧化物酶抗体的敏感性和特异性高于甲状腺球蛋白抗体。
可能是甲状腺疾病：如自身免疫性甲状腺疾病、萎缩性甲状腺炎、产后甲状腺炎等导致的。也可能是非甲状腺疾病：如弥漫性结缔组织病也可见抗甲状腺过氧化物酶抗体增高。也考虑是生理性增高：正常老年女性可能会有抗甲状腺过氧化物酶抗体轻度增高的现象。