中医鉴别诊断如下：临床表现典型损害为生殖器部位的群簇性粟粒大水疱、糜烂、溃疡、自觉灼痛，近卫淋巴结肿大，诊断并不困难。但临床表现不典型的相当多，应当认真询问病史和细心观察，有时可找到些线索。至于无症状的亚临床感染者，只有依据特异的实验检查来确认。但目前临床上尚缺少实用的检测手段。
生殖器疱疹是主要由单纯疱疹病毒||（HSV||）引起的性传播病。单纯疱疹病毒||（HSV||）存在于皮肤和黏膜损害的渗出液、精液、前列腺分泌液、宫颈、阴道分泌液中，可通过性接触而传染给配偶或其他性伴侣，也可在同性恋者中互相传染，引起原发性生殖器疱疹。有时在口腔或口腔周围患有疱疹的人，可通过口腔－生殖器性交，使对方传染生殖器疱疹。
生殖器疱疹初期症状是有局部的小红点，逐渐发展为三个到十个的小水泡以后逐渐浑浊，破溃自身感染的状态，要注意的就是生殖器疱疹的传染性非常强，由于发生的位置在皮肤位置，所以近期不要有性生活。
生殖器疱疹的原因很多，一般是由于单纯疱疹病毒引起的泌尿生殖器感染及肛周皮肤黏膜溃疡，有的是由于不洁性行为导致的，接触了病毒感染的内衣裤，导致间接感染，也可能是共用护用品导致。
生殖器疱疹是在生殖器部位起的疱疹，所以，生殖器疱疹的症状一般是在生殖器的部位，一般在皮肤和黏膜的交界处出现的红斑，这些红斑经过一段时间就会变成水泡，由于这个水泡的泡壁比较薄，水泡泡壁会破裂，会形成浅的糜烂，有些人可以形成溃疡。
生殖器疱疹的典型表现多为集簇性小水疱并很快破溃形成糜烂或浅表溃疡，好发于阴唇、包皮和肛周，不典型表现为非特异性局限性红斑、从部位看可见于阴阜臀部等处。