衣原体感染可以通过外用药物治疗，如克拉霉素。
大环内酯类抗生素是治疗衣原体感染的常用药物，克拉霉素、阿奇霉素、强力霉素、交沙霉素等。如果口服药物治疗效果不理想，可以选择输液治疗。
妇科衣原体感染不仅需要口服药物治疗，还要注意局部清洁卫生，穿宽松的棉质软内衣。
衣原体阳性感染可能是肺炎衣原体、沙眼衣原体等病。
肺炎衣原体可能会侵犯患者的肺部、咽喉部等，容易导致肺部感染，一般表现为干咳、头痛等，主要可以通过唾液、气沫传播。而沙眼衣原体可能会侵犯患者的眼部、泌尿生殖系统等，导致出现结膜炎、尿道炎等疾病。
感染的途径包括性接触、日常接触、日常接触、共享生活用品、浴器、便池、温泉、游泳等。
衣原体的传染途径是通过性接触，少部分是由被污染的衣物，例如内衣，毛巾，浴缸等，在进行治疗的时候，性伙伴要在同一时间进行。养成良好的个人清洁，经常洗手，避免共用毛巾、脸盆等用品。
衣原体感染阳性一般不严重，病情比较轻。
肺炎衣原体呈阳性，说明是已经受到衣原体感染，出现肺炎、气管炎等疾病，容易使患者出现发烧、肌肉酸痛、浑身无力、咳嗽、胸痛、呼吸喘闷、胃口差等症状，通常治疗较为容易，不是很严重。但是，在支气管炎的急性期，不进行肺炎衣原体的处理，会导致病情加重，对身体造成一定的危害。
衣原体感染阳性是体内有衣原体感染的情况。
衣原体通过抑制受感染的细胞代谢，使其分解、释放出溶酶体，从而产生细胞毒性效应，从而诱发过敏性和自身免疫反应。感染后产生的特异性免疫能力弱，持续时间短，易反复感染，清除不彻底会导致持续感染。同时，还有许多没有临床表现的隐性感染。
衣原体阳性并不一定是性感染。
有些病人在感染了呼吸道衣原体后，会出现衣原体性肺炎，其传染方式以气道飞沫为主。也有可能是与沾染了衣服的物体有直接或间接的接触。泌尿道感染衣原体后，就会导致泌尿系统炎症。出现尿频、尿急、尿疼等情况，还会引发阴道炎、宫颈炎等。泌尿系衣原体，通过性交方式传染。
