肾结石应该进行手术治疗。肾脏结石需要根据结石的位置、大小及是否造成肾脏积水等多因素决定如何治疗。最常用的治疗方法是体外冲击波碎石。肾脏结石在2厘米以下的首选治疗方法，体外冲击波碎石无任何创伤。经过体外冲击波碎石后，需要定期进行观察随访，直至结石完全击碎排出为止。如果经过体外冲击波碎石治疗后的肾脏结石，没有任何的排出和改变，则可以选择手术治疗。
口腔结石一般指牙结石。牙结石的去除需要到口腔科进行检查，然后用特殊器械，进行龈上牙石的洁治和龈下牙石的刮治，可以把牙石全部去除，进行局部冲洗，调磨牙齿的表面使其光滑，防止进一步附着细菌、软垢，形成牙石。
牙垢牙结石可以去口腔科洗牙，彻底去除牙结石，平时养成良好的口腔卫生习惯，按时刷牙，不吃甜食，由于平时不注意口腔卫生，刷牙不彻底，导致牙菌斑，牙结石堆积，如果长时间不处理刺激牙体组织会产生龋坏，刺激牙龈组织会产生牙龈炎。
肾结石有传统的保守治疗，有碎石治疗，还有手术治疗，需要根据结石的大小和结石的部位来确定，一般是五毫米以下可以使用保守药物治疗，还有结合运动。如果结石大于五毫米小于八毫米的，可以选择碎石。
临床主要以肺结核以及组织胞浆菌形成的支气管结石最为常见，还包括真菌以及矽肺、寄生虫、异物被吸入等有密切关系。对于无症状或者症状比较轻微的患者，可以定期随访。有明显临床症状，可以根据病情选择支气管镜下取石，或者是手术切除的方法。对于不伴有肺实质损伤的患者，可以首选支气管镜下取石，微创的并发症较小。对于反复出现肺部感染，以及反复大量咯血以及肺脓肿的患者，可以选择手术切除的方法。
