囊肿可以是生理性的，随着生理周期的变化可以自然消失；也可能是病理性的，由于疾病而形成的囊肿，生理性的囊肿无需手术，而病理性的囊肿，往往需要手术来明确诊断并作相应的处理，用热水袋敷小肚子，不用太热，大概敷半个小时左右，注意个人卫生，这样比较有效果。日常生活中多散步，呼吸新鲜空气。多花时间陪伴家人，培养积极的心理状态。
胎儿卵巢囊肿属于一种病症，其病因至今尚未确定，至今还在进行中。有人主张该种疾病是由母体和胎儿两方面产生的促性腺激素作用所致，其治疗原则是以观测为基础。
如果不是特别的原因，可以选择做引产。一般都是正常的，不会对孩子今后的学习和生活造成一定的负面影响。确诊之后，需要考虑胎儿的状况，以及有没有严重的内脏异常等因素，然后再考虑是不是要怀孕。
大部分卵巢囊肿是没有症状的，只是在妇科检查的时候，或者B超检查的时候偶尔发现，囊肿比较大的情况下，有些人会感到腹胀，或者腹部能摸到包块。囊肿如果特别大，可能会出现一些压迫症状，比如尿频，便秘，心慌，呼吸困难这些。卵巢囊肿发生蒂扭转或者囊肿破裂的时候，会有剧烈的腹痛。没有并发症的囊肿，大多没有任何症状。
卵巢囊肿的主要症状就是下腹部包块、月经失调、疼痛等，同时要清楚卵巢囊肿的类型，轻重不同，一般卵巢囊肿在初期大多都没有什么症状，只会感觉到有些轻微的腹胀和不适感，病情严重者会不仅仅是会出现疼痛，还容易出现呕吐和发烧的症状。
可以去正规医院的妇科就诊，如果囊肿相对来说比较大，已经超过了五公分，可以考虑手术。如果囊肿不是很大，可以在医生的指导下服用药物治疗，定期复查。平时要多吃营养容易消化的食物，保持心情舒畅，不要太剧烈的运动。