目前，支原体感染的常用药物为阿奇霉素和红霉素。
支原体为病原微生物，长期接触抗生素，对抗生素有躲避及耐药现象，一但耐药发生，红霉素、阿奇霉素目前没有效果。因此，细菌与抗菌药发生了争斗，需要长时间服药，再用效果极有可能。
若确诊为支原体感染，症状明显者，药物优选阿奇霉素，或者红霉素，如大环内酯类。若服药效果不佳，可选用左氧氟沙星或四环素类等。
如果出现了解脲支原体感染的情况，通常可以外用高锰酸钾溶液、红核妇洁洗液等药。
解脲支原体主要寄居于人体的泌尿生殖道，可通过性接触、间接接触等途径传播。如果感染了解脲支原体，通常可以遵医嘱外用高锰酸钾溶液、红核妇洁洗液等药，以改善局部不适症状。
若外用药物作用不明显，可遵医嘱使用红霉素、氧氟沙星等药。
女性支原体感染会导致泌尿道和生殖道的炎症，目前支原体感染的治疗多采用阿奇霉素片，左氧氟沙星片和多西环素片。
支原体感染病原体为人型支原体、解脲支原体及生殖支原体等，可导致泌尿生殖道感染，其中以解脲支原体感染最多。支原体在阴道内、尿道口周围，宫颈外口和尿液，传播途径以性接触为主。所以，通常需要采取抗生素治疗。
一般情况下，支原体感染阳性用抗感染药进行治疗。
支原体感染呈阳性，一般是感染了支原体，需要用红霉素、阿奇霉素等，或者四环素类、氟喹诺酮类等抗感染的药物进行治疗。阿奇霉素是肺炎支原体的首选药物；如果是尿路支原体的话，可以根据药物敏感性来选择合适的药物进行处理，如解脲原体可以选择多西环素、红霉素等，人型支原体感染可用四环素类、克林霉素等，阿奇霉素可以用于生殖支原体感染。
解脲支原体感染需要进行分泌物的培养，确定解脲支原体的药物敏感性，然后在进行药物治疗。可以服用阿奇霉素片、阿奇霉素片、美满霉素等敏感的药物，服用多西环素，两三个星期后，就可以完全的将解脲支原体给排出体外，从而达到控制炎症的目的。还可以服用三金片，热淋清胶囊等清热利湿的中药。
女性支原体感染可用奇霉素、左氧氟沙星、多西环素等药物治疗。
女性支原体感染可引起泌尿道、生殖道炎症，现治疗支原体感染，可用阿奇霉素、左氧氟沙星、多西环素等药物。支原体感染的病原体包括人型支原体、解脲支原体和生殖支原体，可以引起泌尿生殖道感染，其中解脲支原体的感染率最高。
因此，患者在生活中需要注意个人卫生。