扁桃体和甲状腺是两个不同的器官，生长在不同的位置。
扁桃体的长度在口咽部，正常人张开嘴后可以看到扁桃体，或者扁桃体小的话，有可能缩在扁桃体窝里。而且扁桃体是最大的器官，其中有淋巴滤泡，分泌淋巴细胞、免疫球蛋白，具有人体抵抗炎症免疫功能。但甲状腺位于颈下，甲状软骨与胸骨之间，气管两侧有类似蝴蝶结的腺体结构，也是人体正常器官，分泌人体正常所需生长的甲状腺激素是重要的内分泌器官。
流感和扁桃体发炎的区别在于流感又叫流行性感冒，是呼吸道疾病的一种，主要是由于急性呼吸道感染导致，属于传播速度较快和传染性比较强的疾病，一般是通过人和人的接触，或者是空气传播，发病比较急，需要及时进行治疗，否则会引起并发症。扁桃体是感染性疾病的一种，通常是由于慢性或者是急性导致，如果鼻腔内有鼻窦炎，也会出现此类疾病，要及时做好季节变化和调整心态。
甲状腺肿瘤是一种较为通俗的名词，属于内分泌系统的一种，属于典型的甲状腺结节或是甲状腺肿瘤。根据其良、恶性，可以划分为两类：良性和恶性。甲状腺腺瘤、结节性甲状腺肿、桥本甲状腺炎瘤样变都是良性甲状腺瘤中的一种。甲状腺良性的恶性肿瘤主要有：甲状腺淋巴瘤和甲状腺腺癌，这是一种源于甲状腺的滤泡上皮，属于良性的甲状腺。这仅仅是患者通常所说的一种肿瘤。
第一、是发病原因的差异，甲状腺炎的病因不一样。甲亢病因主要为碘缺乏和抗甲状腺药物治疗不当导致甲状腺功能亢进，而甲状腺肿大可能与内分泌紊乱相关。急性甲状腺炎是由于细菌感染所致，亚急性甲状腺炎和病毒感染有一定的关系，慢性甲状腺炎属于自身免疫性炎症，甲亢属于自身免疫功能性疾病。
第二、是发病机制的差异，甲状腺炎由病原微生物或甲状腺抗体引起的，侵袭甲状腺组织细胞，造成甲状腺滤泡细胞的损害，属器质性病变。
第三、临床表现不同，有原发性和继发性之分。普通甲亢无甲状腺局部疼痛及压痛感，它的特征是甲状腺弥漫性增大和眼的凸出，甲状腺所致甲状腺功能亢进期在1~3个月。
第四、诊断方法不一。甲状腺所致之假甲状亢，除甲亢自身症状，也可伴有局部疼痛，压痛等症状。
甲亢是甲状腺疾病中临床上最常见的疾病表现之一。在所有类型的甲状腺疾病中，属于较难治的一类病症。甲亢中以Graves最为典型，属甲状腺疾病中自身免疫性疾病。在生活中很多人都会患有甲亢，但是不同类型的甲亢所出现的症状也不一样，而且有些甲亢患者还会并发其一些并发症。甲状腺炎包括慢性等各种甲状腺疾病，淋巴细胞性之甲状腺炎，长期纤维甲状腺炎，产后甲状腺炎，也有急性之化脓性之甲状腺炎，及亚急性之甲状腺炎。
因此甲亢属于甲状腺自身免疫性疾病，但甲状腺炎却是许多甲状腺自身免疫性疾病的总称。
甲减和甲状腺炎区别一般是病因、症状等不同。
甲减和甲状腺炎属于两种截然不同的病症，甲减是由于多种原因引起机体内甲状腺激素功能不健全，或甲状腺激素含量较正常值低，并导致一系列低代谢等症状和体征。其中最为常见的就是慢性甲减症和甲亢症。甲减患者发病后产生症状，可累及身体各部位，比如，可发生便秘，皮肤干燥粗糙和高脂血症。其中，最常见的就是由于甲减造成的全身性反应。但甲状腺炎却是一种出现与甲状腺相关的炎性病变类型，其病因多考虑为自身免疫紊乱和感染所致。甲减和甲状腺炎都属于慢性炎症，但是其病情发展的速度却有着明显差异。甲状腺炎发生过程中，甲状腺功能减退的这段时间是可能发生的。