肾囊肿早期一般无症状，但囊肿会不断增大而出现腰，腹部不适或疼痛；后期会因本身囊内液压力增高而破裂出现血尿，或腹部可触及肿块等情况.一般采用穿刺硬化方法治疗，但也容易复发.。此病药物效果不佳，建议不要用药物治疗。
有可能是肾部位局部组织细胞异常增生反应引起的肾囊肿，需要依照具体的症状使用软坚散结的药物进行治疗，从而控制肾部位的囊肿，如果症状进一步加重，肾囊肿进一步增大，是需要及时进行手术切除囊肿的。平时需要注意观察具体的反应调节。
目前西药还没有治疗肾囊肿的特效方法。对于小的肾囊肿，无症状时不需要做任何治疗，但要定期复查，观察囊肿是否继续增大，如果增大到一定程度可以在医院进行囊液抽吸术，并在囊内注射硬化剂治疗。
不管注意饮食，甚至吃药，都没有办法确切的把囊肿给弄掉。如果囊肿一直是维持比较小的状态，那就定期一年左右做个B超看一下，如果囊肿很大，大于五六公分，那就可以考虑，进行一个穿刺治疗，或者进行微创的手术，来治疗肾囊肿。
肾囊肿比较适合含优质蛋白质的食物，注意高纤维素的补充，以及平时五谷杂粮，还有新鲜的水果、蔬菜都可以食用。另外各种牛羊肉、鱼虾这些都可以吃，但是一定要注意口味要清淡，不要吃得过咸，像腌制类的食物，熏烤类的食物尽量还是要少吃的。
肾囊肿是一种良性病变，临床是在肾皮质或肾深部生长的一种囊肿，临床上肾囊肿较小的时候，口服药物的临床治疗室无效果，而且效果比较差，肾囊肿比较大的时候，肾囊肿通过手术切除，可以恢复肾脏的功能。