龟头炎伴真菌感染的治疗主要是应用抗真菌药物治疗。这个一般是与性生活当中接触到霉菌性阴道炎等引起的有关，在治疗的同时要避免性生活。饮食方面要清淡，不能吃辛辣刺激性的食物。
得了真菌性龟头炎，首先可以使用妇炎洁洗液或者是碳酸氢钠溶液进行冲洗。局部一定要保持清洁干燥，涂抹外用药膏，一天涂抹2~3次，坚持用药7~10天，然后再到医院取分泌物复查。真菌性龟头炎是很容易复发的，患者的生活习惯也要改善，一定要多喝水，内裤要穿全棉材质的，而且内裤要勤更换，换下之后使用开水烫20分钟，然后在太阳底下暴晒，这是杀灭真菌的好方法。
一般来说，真菌感染龟头炎可以使用药物治疗。
白色念珠菌感染会导致真菌感染性龟头炎，局部可用5%的碳酸氢钠溶液或高锰酸钾粉1:5000外洗，局部可用硝酸咪康唑软膏或克霉唑软膏外用。每日早晚用，彻底恢复要花4到6个星期。在治疗过程中，由于真菌具有极高的传染性，很容易发生交叉感染，所以穿着的内衣要用热水烫一下，放在阳光下曝晒，细菌在高温下很容易被杀死。
男性真菌性龟头炎,通常治疗主要是抗真菌的药膏进行外用。对于比较严重的真菌性龟头炎,甚至可以采用口服的酮康唑、氟康唑等药物进行治疗,同时要注意生活方式的改变,清洗内衣裤,避免内衣跟袜子一起洗。患者应该尽早前往医院，在专业医生的指导下进行治疗。患者的生活习惯也要改善，一定要多喝水，平时少吃辛辣刺激的食物，忌烟酒，保持充足的睡眠，少熬夜。
真菌感染龟头炎首先就要将包皮龟头清洗干净，保持干燥。因为真菌一般都是在阴暗潮湿的环境下生长，破坏这种生长环境，真菌一般都会慢慢治疗好。也可以外用抗真菌药膏进行治疗。
真菌感染的龟头炎治疗首先就要将包皮龟头清洗干净，保持干燥。因为真菌一般都是在阴暗潮湿的环境下生长，破坏这种生长环境，真菌一般都会慢慢治疗好。也可以在龟头上涂抹抗真菌药膏，一般3到5天就可以治疗好。不主张口服抗真菌的药物，都是以局部用药为主。