碎石对于肾也是存在有一定的创伤，但相对比手术创伤会小的很多，激光碎石只要方法运用得当，掌握得当，不会对肾造成多大的伤害，如果对于体积较大较复杂的结石，可能需要多次治疗后，肾会有一定的损伤。
肾结石使用体外冲击波碎石时，对肾脏存在轻微的伤害，所以不能长时间进行体外冲击波碎石，否则可能会引起肾单位缺失或者肾脏纤维化，甚至造成肾功能衰竭等。在碎石的频率上不能过于时间集中的进行碎石，至少要间隔7天以后才能进行第2次碎石，而且反复碎石的频率从原则上尽量不要超过4次，如果碎石超过4次以上结石没有任何变化，不建议再继续碎石，建议采用其它方式。
体外碎石对肾是有一定的伤害，包括出血、肾进行性的损害，肾萎缩，有的甚至会出现血肿、肾破裂，甚至还有个别报道超声波把脾或者肝也打碎了，这都有可能。所以不但是对肾有伤害，对周围脏器也是有伤害，所以体外冲击波碎石并不是一个完全无创的治疗方法，所以患者和家属一定要小心。
碎石对肾脏有一定的伤害，但是伤害都比较小，碎石几乎都会出现肉眼的血尿，血量的多少与碎石所用的能量成正比，还与患者局部毛细血管的脆性有关，正常一般都是2-3次血尿，严重的患者2-3天之后血尿也会自行消失。
这种碎石对肾脏并没有实质性的一个损伤，属于微创治疗的一种。到专业的泌尿外科或者是结石科来做出一个明确的判断，要根据这种结石的位置和大小的不同来选择不同的治疗方式，碎石以后要注意多饮水，有利于较小的结石排出体外。
会，震波碎石是指体外冲击波碎石术，是在体外利用超声波将结石震碎。由于结石与肾脏的密度不同，超声波遇到结石后就会释放能量将结石碎开。理论上体外冲击波碎石是精准碎石，对肾脏损害很小。但由于体外碎石机质量参差不齐，质量较差的碎石机做不到精准碎石，会对肾脏产生损害。