膝关节腱鞘囊肿主要是由于膝关节的滑膜炎和无菌性炎症液体渗出引起的，可以通过药物和手术进行治疗。
患者首先要多注意多休息，尽量不要久站走路，要尽量不要攀高、攀岩，要注意保暖，要及时服用一些抗炎止痛的药物，同时还要配合一些活血的中药进行热敷，这样才能起到治疗作用，一旦病情加重，就要及时进行外科手术治疗。
腱鞘囊肿可伴有长期劳损、感染等，伤害和其他原因之间存在某种联系。患者一般会出现一侧或者双侧疼痛的症状，也有一部分是单侧疼痛。以病部圆形肿块为主，有些酸疼。随着人们生活水平不断提高，越来越多的人患有不同程度的腱鞘炎症状。对腱鞘囊肿有非手术治疗与手术治疗两种。非手术治疗就是用药物或者是针灸来进行治疗。保守治疗是用挤压的方法将腱鞘囊肿击碎，接着，泡液就渐渐地自己吸收了，但也存在一定复发机会。手术疗法是对已经发生了病变的患者进行彻底的破坏。操作方法是可摘除腱鞘囊肿，手术后注意防护，避免反复发作。
肌腱囊肿可保守治疗，也可以手术进行治疗。
肌腱囊肿又称为腱鞘囊肿，指肌腱腱鞘或关节处的韧带发生劳损性炎症，引起局部组织膜下积液，积液量渐多，可形成囊肿。腱鞘炎主要是因为长期的紧张劳累以及不良生活方式等因素造成。腱鞘囊肿可局部压揉，有时可将积液捏碎吸收囊壁粘连即可。如囊肿较大，不只影响美观，也会带来痛苦，就必须考虑手术切除。
小脑囊肿主要包括，蛛网膜囊肿，表皮样囊肿和皮样囊肿。如果蛛网膜囊肿，体积不是特别大，没有明显的占位效应，患者没有神经功能障碍，可以动态观察，如果复查发现囊肿有所变大了，再考虑手术治疗。手术方法包括，囊肿切除术和囊肿内引流术。
脑囊肿的治疗方法，主要需要根据或者囊肿的类型，囊肿的大小，以及囊肿是否引起患者相关的症状，来决定的治疗方式，对于没有任何症状的脑部囊肿，特别是脑部的蛛网膜囊肿、松果体囊肿等，并不需要特别的外科治疗，而对于引起比较明显症状的囊肿，例如表皮样囊肿等，在诊断明确之后，需要在神经外科，通过显微神经外科手术来进行囊肿切除，症状多能够逐步消失。
