会的，能会出现疼痛，因为第五跖骨基底部有许多肌肉、韧带的附着点，骨折之后此处的强度减退，在劳累之后，久站、久跑，很久的运动之后，这个地方会残留疼痛。第二，可能出现骨折不恢复，假关节形成。因为第五跖骨基底部骨折端移位趋势非常明显，如果没有固定，其后可能会出现骨折不恢复。
第五跖骨基底部骨折，一般都采取手术治疗，因为骨折端有一个明显的分离趋势，如果不进行有效的内固定，骨折断端会进一步移位，从而影响骨质的愈合。如果不做手术会可能会出现疼痛，因为第五跖骨基底部有许多肌肉、韧带的附着点，骨折之后此处的强度减退，在劳累之后，久站、久跑，很久的运动之后，这个地方会残留疼痛。
第五跖骨基底部骨折，一般都采取手术治疗，因为骨折端有一个明显的分离趋势，如果不进行有效的内固定，骨折断端会进一步移位，从而影响骨质的愈合。如果不做手术会可能会出现疼痛，因为第五跖骨基底部有许多肌肉、韧带的附着点，骨折之后此处的强度减退，在劳累之后，久站、久跑，很久的运动之后，这个地方会残留疼痛。
对患者发生第五跖骨骨折，留下的后遗症主要和治疗不够规范有关，也有骨折迟迟不能愈合的，有畸形愈合的，也有未愈合所致。
此种情况下，若患者骨折端，移位明显，又未采取复位手术，则极易造成骨折端变形愈合，未愈合，甚至推迟愈合。会造成出现明显踱步、负重疼痛等症状，而且负重后，也易留下足部出现明显肿胀，这是因为骨折后，患者进行外固定等处理，固定过程中踝关节脚趾屈伸活动受限。
若晚期患者进行功能锻炼，牵拉粘连挛缩韧带关节囊痛显着，且患者怕痛，不愿运动，还易造成脚趾、踝关节屈伸功能障碍状况。
跖骨骨折是否会有后遗症需要根据实际情况来判断。
跖骨骨折的患者，可以通过积极的配合，在可以运动的情况下进行功能训练，不会有任何的后遗症，但跖骨骨折患者，错位比较严重，如果不及时的进行手术，很可能导致骨折不连，甚至是不能愈合，甚至是不能正常行走。由于治疗不当，后期缺乏运动，可能会出现一系列的问题。
患者在跖骨骨折后应该及时就医治疗，经过治疗后应该积极进行功能锻炼。
第五跖骨基底部骨折后遗症主要是疼痛。第五跖骨基底骨折最大的特征是骨折的延迟愈合及不连，应尽早进行手术治疗。主要采用张力带内固定和空心螺钉内固定等方法。术后、治疗后或未治疗引起的骨折延迟愈合，其后遗症以疼痛为主。患者在走路和足部活动时会有长期的痛苦。患者的脚扭伤后，持续的疼痛无法减轻，并且仅限于足背或者偏外侧，需要考虑是不是伴有第五跖骨的基底骨折。