分为三期，一期指的是没有出现转移的，并且肿瘤小于两公分的患者；二期指的是肿瘤已经出现了脑部转移或者是肺转移，肿瘤在四公分左右的；三期指的是已经出现了远端转移的患者。
分期为Ⅰ期，45岁之前分化型甲状腺癌未出现其他转移者、肿瘤小于2公分者。Ⅱ期，45岁之前分化型甲状腺癌有脑转移及肺转移者、肿瘤4公分以上者。Ⅲ期，肿瘤四公分以上，出现远处转移者。Ⅳ期，45岁之后分化型甲状腺癌者、肿瘤4公分以上并出现骨转移者、甲状腺未分化癌者。
甲状腺癌可分为早期、中期、晚期，主要根据肿瘤本身的大小、是否突破包膜、有无区域淋巴结转移等因素，进而划分进展程度。甲状腺癌的肿瘤外层存在一层包膜，肿块较小，且限制在甲状腺包膜内的阶段，可称之为早期；当肿瘤突破包膜，根据淋巴是否存在周围脏器的转移，以及术后复发的风险度，来诊断病情的严重程度。
依据肿瘤的浸润程度、病理组织学类型及年龄等，来确定甲状腺癌的临床分期。其中，分化型甲状腺癌（乳头状、滤泡状）的临床分期与年龄关系密切。甲状腺癌按疾病进程共分为4期，包括Ⅰ期、Ⅱ期、Ⅲ期和Ⅳ期。分期数字越大，病情越严重，治疗难度越大。术前的分期主要用于判断是否需要做手术，并评估术后是否需要辅助放化疗。
一期：甲状腺癌肿块较小，用手在甲状腺表面不能触及；甲状腺内有单个结节，甲状腺形态无明显改变，放射性核素扫描甲状腺内有缺损；甲状腺内有单个或多个结节，腺体活动不受限制；周围区域未触及淋巴结，远处无转移。二期：在一期的基础上，同侧、对侧或双侧淋巴肿大，活动较好，无远处转移。三期：甲状腺内的肿块穿透甲状腺包膜，肿块固定或侵犯周围组织；淋巴结肿大并固定不动；远处仍无转移。四期：甲状腺癌合并远处转移。
手术前做全身全面检查，了解大概的临床病理分期，这个是叫手术前的分期，也叫临床大概分期。手术后病理分期，就是手术以后拿下来的东西进行化验，再结合全身检查，这个叫临床病理分期，属于国际通用，非常准确的分期。