脑部CT和核磁共振相比较，肯定是CT有辐射，而核磁共振没有辐射。因为CT的检查原理是通过X射线来进行扫描，这个检查是有辐射，无论做什么部位都有射线。而核磁共振的检查原理是通过磁场来进行扫描，没有辐射。所以这两个检查的原理不一样，CT有辐射。
脑部的检查可以选择做CT或者是核磁共振，各有其优缺点，针对脑梗塞，核磁共振优于CT，因为核磁共振能够发现超早期的梗塞病灶，而6个小时以内的梗塞病灶，在CT上是不显影的，所以针对脑梗塞，核磁共振是优于CT的。如果是针对脑外伤，就会选择CT多一些。
脑部的检查可以选择做CT或者是核磁共振，各有其优缺点，针对脑梗塞的病人，核磁共振优于CT，因为核磁共振能够发现超早期的梗塞病灶，而6个小时以内的梗塞病灶，在CT上是不显影的，所以针对脑梗塞的病人，核磁共振是优于CT的。要是针对脑外伤的病人，就会选择CT多一些，因为CT检查时间快。
脑部ct能观察脑内出血，梗塞，肿瘤，骨折，尤其是颅内的钙化。脑部核磁共振对早期脑梗塞观察比脑部ct要早。对于脑部病变，脑部核磁共振优于脑部ct。脑部核磁共振不用打造影剂，可以进行脑血管成像，对脑内神经病变显示比ct更清楚，更明确。而且核磁共振没有辐射损伤，这一点明显优于ct。因此脑部疾病检查尽量选择核磁共振。
脑部做核磁共振的检查要优于CT的检查。因为核磁共振的检查更清晰，特别是后颅窝的病变，当CT检查时因为有颅底颅骨的伪影，对脑干和小脑有可能会存在一部分伪影的现象，所以对于一般的病变的检查核磁共振更好。
每个地区的收费都是不一样的，头部ct大概2百-4百元，头部核磁共振7百-1千元。核磁共振几乎适用于全身各系统的不同疾病，如肿瘤、炎症、创伤、退行性病变以及各种先天性疾病的检查，注意劳逸结合，放松心情，饮食清淡，避免吃辛辣油腻刺激性食物。保持好心情。