益生菌可以空腹吃，在早饭前或早饭后一同服用。早上空腹吃有利于其吸收是可以的，不用担心。益生菌有助于胃肠蠕动，放松心情，保注意，休息，合理饮食，合理锻炼身体。多吃些新鲜水果蔬菜和富含蛋白质的食物。不要吃辛辣生冷食物，过烫等刺激性的食物。
益生菌晚上饭后吃比较好，尽量不要空腹吃
益生菌系一种对人体有益的细菌，服用后能活着进入肠道，对人体有益的细菌，它们可直接作为食品添加剂服用，以维持肠道菌丛的平衡。建议饭后30-60分钟后服用益生菌对胃酸很敏感，正常胃酸PH值为1.8左右，这样的环境不利于益生菌的存活。因此需要找到胃酸低，即PH值相对较高的时机服用益生菌，在餐后半小时-1小时后，达到了饱腹感，胃酸的分泌有所减少，加之此时食物还在胃中，可以中和胃酸，PH值有所升高，大大减少了对益生菌的破坏，这期间摄入益生菌是比较适合的
注意事项：冲服益生菌要用37摄氏度左右的温开水，水温过高，会导致益生菌死亡。益生菌不可与抗生素类的药同时服用
一般情况下，怀孕后孕妇能吃益生菌。具体分析如下：
益生菌是一类对鱼，宿主有益的活性微生物，含有乳酸杆菌，双歧杆菌、放线菌、酵母菌等有益菌。在人类的肠、性器官中进行定位，可对机体的健康起到一定的保健效果，提高机体的微生物生态平衡，起到良好的保健效果。怀孕的时候，孕妇可以吃益生菌，可以帮助宝宝们调节肠胃的菌群，使肠胃的功能得到改善。另外，还有一些有益于人体内的钙质的摄取，可以提高人体的免疫功能。
胃不好能吃益生菌。
益生菌可以调节人体的胃肠道菌群、改善营养吸收、促进身体的免疫功能。因此，胃不好的患者是能吃益生菌的。在日常生活中，患者要注意饮食健康，戒烟戒酒，以清淡和易消化的食物为主，忌辛辣刺激及油炸的食物，多吃新鲜的水果和蔬菜，少食多餐，不要暴饮暴食，保持心情舒畅，注意多休息，避免过度劳累，应适当运动，比如慢跑、游泳等，有利于身体健康。
益生菌是一种对宿主有益的活性微生物，通过定殖在人体内，改变宿主身体某一部位的菌群组成，具有调节粘膜和免疫功能，改善肠道内菌群平衡，促进肠道吸收。
产后便秘主要是由于产后腹部或盆底肌肉组织松弛，长期卧床，导致身体虚弱，导致肠胃功能下降，饮食结构不合理，膳食纤维摄入不足。可以通过口服双歧杆菌、肠胃健益生菌、乳酸杆菌等益生菌来调节产妇肠道菌群，促进肠道蠕动，改善便秘症状。
但是，益生菌属于外源性细菌，长期服用会影响人体自身产生益生菌的能力。所以孕妇要养成良好的生活习惯，而不是依赖益生菌，如不适症状较严重，建议前往医院进行治疗。
拉肚子的时候可以吃益生菌。益生菌有利于恢复肠道菌群生态平衡，控制腹泻，增加益生菌的数量能抑制肠道致病菌的生长繁殖，限制条件致病菌的生长。应用益生菌对感染性腹泻特别是病毒性腹泻有明显的疗效。对于慢性腹泻患者，可以使用活菌制剂进行治疗。需注意的是，益生菌和抗生素不能同时使用，因为很多抗生素都有抑制或杀灭益生菌的作用。