使用牙线只要方法正确是不会对牙齿有危害的，而且对于牙齿很有好处，比刷牙比较好，牙线是比较能够彻底清洁牙齿的工具，尤其是对于牙齿缝隙的清洁作用比刷牙更彻底和干净，能坚持使用对于保护牙齿预防龋齿是非常重要的。
牙线会更好一点。牙线大多是一次性的，不可重复使用，因为使用过的牙线上面的污垢，细菌不能用普通的方式（水冲等）进行清洁，重复使用牙线有百害而无一利。刚开始使用牙线时，操作有些不便并会有牙龈出血现象。用尼龙线、丝线或涤沦线来清洁牙的邻面菌斑很有效，特别是对平的或凸的牙面最好。拉下一段约25cm的牙线，将线的两端打双结形面一线圈，或取约33cm的牙线，将线的两端绕在二个中指上，用右、左手指将牙线通过接触点。建议饭后剔牙或周期性的清理牙缝。使用时注意方式和力度，注意牙线卫生。
牙线棒没有传统牙线好。因为牙线棒只有一小段的线。而且棒上的线不像传统牙线那样自由弯曲。但是牙线棒和牙线主要还是要看个人习惯，主要还是使用手法上有所区别。牙线的使用需要一定技巧。截取一段牙线并用中指缠绕住，拇指和食指配合，控制牙线的力度和位置。将牙线慢慢摩擦进一个牙缝，直到接近牙龈，然后清理牙缝和牙龈下面。每一个牙缝一定要用干净的未使用的牙线部分来清理，以免交叉感染，自然用过的牙线不能再次使用。推荐使用牙线，相比牙线棒更加的卫生环保和方便，注意口腔清洁，睡前刷牙，不要过度依赖牙线。
问题分析：从您描述的情况来看，如果时间长了这个牙龈可能会包上去的，但是短期里面可能还会有一个缺口。
指导建议：最好去医院进行检查一下的必要时可以通过修补处理。
牙线棒是不会有什么危害的，牙线棒方便、卫生等，而且还能帮助清洁口腔残留的食物，是清洁很好的工具。平时在刷牙时也可以适当的用些食盐，长期坚持对牙齿是有好处的，早晚刷牙，多漱口。