如果疼痛剧烈，不建议再灌肠治疗，可以休息2-3天再灌肠。也可以在肛门外擦点痔疮膏来缓解。灌肠的时候，导管可能会伤到直肠粘膜，出现疼痛和排便感，可用高锰酸钾溶液坐浴，缓解直肠粘膜水肿，缓解疼痛，减少排便刺激。
如果孩子出现腹泻，需要考虑腹泻的原因，检查大便常规，了解是不是感染引起的，比如病毒感染或者是细菌感染。需要积极的给予保护肠道粘膜药物和抗感染药物治疗，缓解孩子的症状，避免灌肠。
胃肠道手术前有些病人需要灌肠，主要针对结肠病变，小肠病变不需要灌肠。在结肠手术前因为结肠内有大量大便，灌肠目的是把大便排干净、清洁肠道，为手术中肠道切除后做进一步吻合而准备。现在做手术的过程中，结肠手术可能不需灌肠，吃泻药拉肚子就可以把肠道准备干净。
保留灌肠是用导管经肛门插入肠道内，并且由此注射入液体，达到通便排气，促进肠道蠕动，软化大便降温催眠等作用的一项操作，保持肠道清洁。同时灌肠时插入肛门深度约10到15厘米左右，流速要慢，压力要低，以便于灌肠液的保留。
保留灌肠是用导管经肛门插入肠道内，并且由此注射入液体，达到通便排气，促进肠道蠕动，软化大便降温催眠等作用的一项操作，保持肠道清洁。同时灌肠时插入肛门深度约10到15厘米左右，流速要慢，压力要低，以便于灌肠液的保留。