约2-3周左右。可采用切开加挂线疗法，是高位肛漏的一种常用手术方法。此法具有简便、经济、不影响肛门功能、瘢痕小等优点。其机理是切开部分漏管周围组织后利用结扎线的机械作用。
传统挂线疗法是用药制丝线、医用丝线、橡皮筋等材料，缠扎患病组织，利用“挂线”的紧箍力，阻滞气血、经络，使局部组织坏死，以剖开瘘管或窦道，治疗肛瘘及各种窦道的方法。切开挂线法是将瘘管全部切开开放.靠肉芽组织生长使伤口愈合的方法。适用于低位肛瘘，因瘘管在外括约肌深部以下。切刀开后只损伤外括约肌皮下部和浅部，不会出现术后肛门失禁。
不做手术，肛瘘可能会有流脓和渗液的现象，可能会发生反复的感染或者出现疼痛等局部症状。
如果有肛瘘，但是不做手术的话，这种情况因为局部炎症的反复有可能会导致肛周脓肿或者是有大便失禁的可能性，肛瘘不做手术由于其炎症长期刺激肛周，有可能会由普通的低位单纯性肛瘘而变成复杂的高位肛瘘，同时，部分肛瘘的患者由于其长期不治而有可能会出现癌变的可能。
建议到正规医院的肛肠科进行检查，及早在医生的指导下治疗，万不可拖延病情。平时注意不要吃辛辣刺激性的食物，会加重病情。
肛瘘术后可以抽烟，但是尽量少抽。术后需要每天肛门中药坐浴，然后摸药膏，每天肛门消毒换药，大便后也需要清洗肛门。注意饮食，不能喝酒，不能吃辣椒，多吃水果和蔬菜，清淡饮食，保持大便通畅。便秘、腹泻会引起伤口水肿。一般术后一个月左右伤口可以完全愈合。
临床上肛瘘有两种治疗方法：堵塞法：无创伤无痛苦，适合于单纯性肛瘘。手术治疗：原则是将瘘管切开或切除，形成敞开的创面，促使愈合。手术的关键是尽量减少肛门括约肌的损伤，防止肛门失禁，避免肛瘘复发。肛瘘难以自愈，不治疗会反复发作并形成直肠肛管周围脓肿，因此绝大多数肛瘘需手术治疗。